EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-12892 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:23082779-23083330 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr18:23083002-23083014GAATGTTGGTTT+6.04
IRF1MA0050.2chr18:23083237-23083258ACCCACTTTCAGTTTTTCTTA+6.67
LHX2MA0700.1chr18:23083168-23083178GTTAATTAGT-6.02
Enhancer Sequence
CCAGGAATTT TATTTGATAC CTGTGATCTA AAGATTGAAA GTTGTCAATG ATCAGCATTT 60
CATTTTATTT CAAAGTCGAT GGTAGGAATT TAAGGGTCAA GAATTATCGG TGGGATGGTG 120
AAGTCAGAAG TTATGACCTA CCTCTAGCTT AAACCAAATA TACACAAGTA AGAGGTTATT 180
TATAGAGAGC AGATTCAGGT TGTCTTGAGT GTAGAGGAAA AACGAATGTT GGTTTAGTAG 240
AATGTTAAAG ATTTATATAG TTGGAGTGTG CTTTTAAACC ACACTGTGGT CAGAAACTGG 300
GCACCAGGAG TGTATTGAGG TCTCTATGTA TTTTAAAGAT GCCAGAGAGA GAACTTGACC 360
AAACCAGCAT CCACACAAAA CAGTCCTGTG TTAATTAGTC CAACTTTCTG CTTTCTATGT 420
GTGTCTTGCG CTGTGTATCA AAGATAAAAC CTTTGCTGAC CCACTTTCAG TTTTTCTTAC 480
ACCCCTTTAC TTAATGCTGG CATTAAGGCA AAATACACAG GTAGTGGATG GCTCTTTTTG 540
TAATGAATGA A 551