EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-12754 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:16202093-16203599 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr18:16202343-16202354TATGTAAATAT+6.62
FOXC1MA0032.2chr18:16202343-16202354TATGTAAATAT+6.62
LMX1BMA0703.2chr18:16202257-16202268TTAATTAAAAC-6.14
LMX1BMA0703.2chr18:16202254-16202265AATTTAATTAA+6.32
Nkx3-2MA0122.3chr18:16203523-16203536TAAAACACTTAAT+6.16
Enhancer Sequence
GTACATTGCA ATATCAATGT TGAAACGATA CATTGTGCAT CTCTACCACA AAGTCATAAT 60
TACAAATGGG AAACAGGTTT TCTTTAGGCC CCGACCTGTT GAATTGGAGA CATGCTGAAG 120
TGCAATGGAT GAAGCATCGA TATTGATGAA AAAATTGTTA AAATTTAATT AAAACCTAAC 180
TCTTAAAAGA AAACTACCTA AAACAACTTT GCTTCTTAAC ATATAACATT GTTGTGCAGT 240
TGTGGTAGAA TATGTAAATA TAAAACACCT TATCAACTGG AAAAAAACAC TGACACATCA 300
TAATTGCAAC TTGCCAATTC GCAATAGACT AATAAGATTT AAAATGTCTC TCACTGTGCC 360
AATGTGAAAG AAAGTCACAG AGCAGCTATG GCAGTTGTCC TCTTGAGCCA ATGGCGCTAT 420
TCTAAGCCCT ACTGTAGTCT GCAATGTCAA TTAACATCAA GCTAAAACTC CAGAAGGACC 480
CATCTAAAAC ACACAATCAT GACAACATCA CACAATGTTA TTAAATAGCT AAAAGCAGTT 540
TTATCCTAAA AGTAAACCTG TACACAAATA AACGTGAATT GCCTAAAATG ACGGAAGACA 600
AAGCAGCTCA CTTTTATTGC ATCCATCAGG CCGCTGTAAT GAACAATGCC TTCAGTAGGG 660
GGAGCAAATA TCAAAATAAA GTGTACTGGG AACAAATACT AATCTATAAT AGAAAAAGAA 720
TTTGCAGAGC TGACTCAATA AGCTGATTTT AAAGAAATAT ATTTTCATGA TAATGTAACC 780
CTTTGTTTGT TGTATCGTTC TGAAAAGACG AATTGTCCGA AAAGATAAGC ATCTCTGTCG 840
CGGAGTGATC TTCATTACGT TTGTCCTTCT CGAGGCTCTG TACTTCTCTA CTGTATTTCC 900
ATAGCAACTG CGGAGGACGC GAAAAGACAG CGTGAGGTGA AAAGAAAAAC ACAGGGCAGG 960
TACTTTGTTT CCAATAAAGG CAGACAGAAA GCGGCATGTG TTTTATATAC TTATGAGATG 1020
TTTGTATATC GTCATTATTA TATATTTGTA TTTATGCTGT CGTGAATTTA CTTCAGTTGC 1080
AAATCTGCAC GTCTATTGTA ACAAACAGTT CGTTTCTCCA GGCGGTTTGT TGATTCTTGA 1140
TCCGCGAGAA ATGGATGATA TCGAACGGGC AATTGACGAG GAGCTTATGA AATTAAACCT 1200
TCACCCTTCT GAAAATGATA TAGAGTCAGA CGATGACAGC AATGATTTGA ATAACGTTAG 1260
TAATGTAAGT GGCCATTTTA TTTATTAAAT CTACGGCGAC TTTCAAACGC CGTATTTTAA 1320
CTCACTTTTT AATGAAAACT AATTTATTTG CTGACATAAA ATATGCTGTT AGTAATACCA 1380
AAGTCCCTTT AAGCCATTAT TATGTATATA CCAAGTTCAA TATGTTTCAT TAAAACACTT 1440
AATTCTGTTT AAATTGTTAT GAGTTAAGAC AAACACATCA ATTAACATCA AATAATGTTA 1500
TCATTT 1506