EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-12656 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:10753646-10754865 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr18:10754276-10754288GTTTGTTTGTTT+6.32
HNF1AMA0046.2chr18:10754510-10754525GTTTAATGATTAATT-6.49
Sox6MA0515.1chr18:10753993-10754003CCATTGTTTT+6.02
ZNF384MA1125.1chr18:10754285-10754297TTTTTTTTTACA-6.07
Enhancer Sequence
ACAGTGTTAC AGTTTAGCAC AACACTAAAG CTCACTTGCA AAAGCTCATA CCTTTCCCAA 60
AACAGTTCAC TCATGTGTCA AAACTAAATT TCCTTTTCAT TTAAACAGTC AGTGCCCCCA 120
AAGTGCTTCA TCCCTTTAGC ATTGTGTAAG CGCTGCAAGT TACAGTTTTT CTTGTTTGCT 180
TTGACCTGGT TAAAGAAACT AGGTTCCACT TTATTTTCAT TATCATTATC CCAGCAGAGT 240
AAAAGACAGG TCTTGCAGAT GTGTAAACCC TTTCTCATTG GGTTGACACA TTTTCCCCAC 300
CATTTATCAA AACAGTTAAC ACGGATGTCA TTCAAGCAGT CCAAACTCCA TTGTTTTAGC 360
TATGGTAACC AAATAGAAAC CATCTATTCC TAACCATTAA AAACTACCAA GATCAGTATG 420
AATTCACTAA AGCACCGGTT TGACACACCT TCACACAAAT CTTCATTTAG CAATCAGTCT 480
GCAAACATTG GAAATGATGG AAGGTCTGTG TTTTGTGACA GCATGGATGG AGAAGGTCAA 540
TAGTGGCTAT TTCCTATACT CCCAAAAGAT TTGATTGTAT ATTGGTTTAC ATGTGTTTTC 600
TCTAATATTT TACAGTATTT TATTACTTTT GTTTGTTTGT TTTTTTTTAC AGTATTTCAG 660
ATTTCAGGCA CAGTTTGAAA AATGTCATGA ATTCAATATA AATTTAATCA AAGCATTTCT 720
TATTCTGCAT CCAATTCTTT GCAAAAATGC AAATTTAACA GCCCAAATAG AAAGACAACA 780
AATGGCATTG GTAATAGGCT ACAATGTCAA GTAATGCTGC ACTGATTCAC ACTGAGTTCT 840
GTATTTTGTG TTTTGTTGTC CATTGTTTAA TGATTAATTG AAAGAACTCA TATACATGTT 900
TGCAAGTCGT TTTGTTTGAA GGTAAAACTA GCTTTTGTTG CATATTGTAA ATGATTTGAC 960
ACGGTATGTG AGTTTTGCAA GCAAAATGTG TAATTTCGAC CATGAGTGCC GCTGTTTAGG 1020
CCTGTGTGTT AACTGTTTTG AAAATGTGGA GTTTCAGTTG ACGGCTGCAT CAAAGCGAAC 1080
AAGAAAAACA GTAATGTTTA GATGTTTTGT CATTATGGCA CTAAAATATC CCTCATGTCC 1140
ACCTTACAAT CTTAGCCCAG TCCTTTATTG ACAATGGTCA CTGTACTGTT TTGTCTAGCT 1200
AACAGAATAC AAGTGTGTA 1219