EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-12560 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:7277363-7279123 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr18:7278415-7278425TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr18:7278415-7278425TTTAATTAGA-6.02
FOXA1MA0148.4chr18:7278560-7278576GTTTGTTTACCTAAGG-6.85
Foxj3MA0851.1chr18:7278558-7278575GTGTTTGTTTACCTAAG-6.76
IRF1MA0050.2chr18:7278401-7278422TTTTTCTTTCATTTTTTAATT+6.23
JUND(var.2)MA0492.1chr18:7277370-7277385AATAATGATGTCACA+6.02
POU1F1MA0784.1chr18:7278854-7278868CTAATTTGCATAAA-7.34
POU2F1MA0785.1chr18:7278856-7278868AATTTGCATAAA-6.11
POU2F2MA0507.1chr18:7278854-7278867CTAATTTGCATAA+6.13
POU3F1MA0786.1chr18:7278855-7278867TAATTTGCATAA-7.22
POU3F2MA0787.1chr18:7278855-7278867TAATTTGCATAA-7.22
POU3F3MA0788.1chr18:7278855-7278868TAATTTGCATAAA-6.74
POU5F1MA1115.1chr18:7278856-7278867AATTTGCATAA-6.14
Pou2f3MA0627.1chr18:7278853-7278869GCTAATTTGCATAAAA-8.17
RESTMA0138.2chr18:7278691-7278712GCTGCTGTCCTTGGTGCTGAA-10.14
Enhancer Sequence
GAGAACAAAT AATGATGTCA CAATTGCTAA CTGCTTTAAT AATTCCAAAA TGCTTCATCA 60
TAAAATGTTT TGTCAGCAAT GCATGAATTG TGTTTCCTGT CGAATATATT CCTCAGATAG 120
TTCGTGACAG TATAATTAGA CTTATGCATT CAGCTTCTGA GTTTGTCTGA GGGGATAATG 180
ATGTCACAAT TGCTTAATTA AAAAATGCTT TATCTAAAAA TATATTTTAT AATTAATGTG 240
CGTTAAATTG GGATACCGGT CAAATATGTA CCACGGATAG TTCGTGACAG TATAATTAGA 300
CTTATGCGTT CGGCTTCTGT TTGTGAGAGA CACCATGTGT GTGTGGAGGG GGAGGGGGTT 360
GTGTCGGCTG TCACCGTTCT CTCTCTCTCA ATCCGTCCGA CTCTCTCTGG AAGTTTGAGC 420
GTCTCGAGCT CCACGGAATT AACGGCAGCA GCACGAGCGC GTTAAGCTGC GGATTGTCCA 480
CCATCTCACC GGGAGCACAC GAACATGGCA CTGAACAGGT CGCCCTCTGC CACGGGTGAG 540
TACCAGCCTG ACACCCCGCT TCATCTTTGT TGATGGTGTA ATTTGCGCGC GCGCGTGCAT 600
TGGGTTTTCC TGAGCCAAAC AGAATATTCG CTTGCTGCAC GTCTGTACAG TTGAACACTC 660
TTCAATAAAT TGGCTTGTTT GTTCAAAGCT ATATGCAGAT GCGTGCTTGT GTTTGATTTA 720
ATCGTGCATT TATAATCAGT TTGTGTGAAC GCGCTGAGTG GCACCAAACT GGTCGCTTGC 780
ATTAATTGCA GTAAAATCAA AGGCGCGCGG TAGCTATGCT TATTTCTGAT GGGATATCAT 840
ACTTTGATAC TCACTAATCC TTTGGTTAAT TGTGTCAGAA TTTCTGCTTT TTTGTTTTAG 900
AAAACAAAGA GGAGGGCTGA GTGTGTCGGA GGGGGTTTGT ATAATTAGCT GGGGCAATAA 960
TCTGGAGCTA TTTCAAGCGC CATCTGACGC CATGTGTTGT CTTATAAATC AACAGCACTT 1020
TAGGAATTGT TTCTCTCATT TTTCTTTCAT TTTTTAATTA GATCACAGAA CTATTTTGTT 1080
TTAAATCGAA AATCTGAAAA TGAATGGAAG TAAAGGCACA AATAGACTGA TGAGATGCAT 1140
GGTTTGGTCA GGTGGTGTAA ATGGGCTTAG CTTTCTCTAA GAGTCATGAA TCCCTGTGTT 1200
TGTTTACCTA AGGGCATGAG GCATATTTAA GTGACGCTTT AGTGTCAAGT GTGAGAATAT 1260
TTACAGATAT CACTGTTTCT ATTCTCGGTC ACTTGTACAG GTTTCTGATC ATTGACGCGC 1320
ATAGCTATGC TGCTGTCCTT GGTGCTGAAA GGTTTTTATT CTCCACTTTT ACGCGGACGT 1380
CTCTCTCTCT TTCTCTCTCT CGGAGTTTCA TTAAAATTCC ATGCGATTTA TTGGCGTGAC 1440
TGCTTTGCAT GAATGATTGT CAAAGAAAGA GATGGCAGTC ATTTTAAAAC GCTAATTTGC 1500
ATAAAAAGAC TATTAAAGGA CAATGACAGC TAATTGAGAA AATCTCTTAC AGAAAACTGG 1560
AATGGGGCTC CCGAGCGCAT GCGTGTTTCG GCTGTGAGGA GCGATTCCTC TTCAATGCAG 1620
AGTGAGAAAC TCCGCGGTGT TGCCAGAGAT ATCTCTGAAC TGGGCCAGCG GGGCACGGCC 1680
AGCAGCGGGC ATGATGCCAA CGACATCGCA GAGGACACGG TGTGTATATG AGGAAACTTT 1740
GTTTATTGTC AAAGAAATCA 1760