EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-12507 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:5441910-5442588 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr18:5442549-5442564TTTGTTTGTTTAGCG+7.26
IRF1MA0050.2chr18:5442476-5442497ATCTACTTTCACTTTCGCTCT-8.49
IRF2MA0051.1chr18:5442475-5442493GATCTACTTTCACTTTCG+7.45
IRF7MA0772.1chr18:5442480-5442494ACTTTCACTTTCGC+6.57
Lhx3MA0135.1chr18:5442538-5442551AAATAATTAATTT+6.78
POU4F1MA0790.1chr18:5442536-5442550ATAAATAATTAATT-6.63
RUNX1MA0002.2chr18:5442054-5442065AAACCACAAAC+6.02
Enhancer Sequence
AAGGGGCTGT GTACGAGTGC GAATGGAGAA AGTATTGCAG TGCCTCAGGC CAGAAACCAT 60
TTTCATTAAA TGAATTGATT AATGATAGTT TTTTTCTGAA TGTTAACACA GTTTTTGTTT 120
AAAAATACAC TCCTTAATTC TTAAAAACCA CAAACCATAG AGTATAGTGC AGGTTAAATC 180
ATCATGTTGG TTGTAGTTTA GACACATGGG GCTGTATTTT GACGGTCCAT GCGCAGAGCG 240
CAAAACGCAG GGCGCAAACG CTTTCAGGCC GTGTCAGGAC GCGTTTCTGC TAATTTAAGG 300
ACGGGAAATC TGCTTTGCGC CGCGGCGCAT GTTCTAAAAG GGTTGAGTTT ATTTTCCTAA 360
TGAGTTATAG GTGTGTTTTG AGAATAAACC AATTACAGTC TGATCTCCCA TTCCCTTTAA 420
GAGCCAGCTG CGTCACGCCA AGAGCACATT CACTATTTAC AGGATGCAAA GTAAGTCTAA 480
GTGGAAAAAC TGAGCATTTC ACTTGCAAAC AGTTCACAGA ACACAGTTAA ACAGAGCATC 540
TACTGCGTGA GAATGAGAGA TAATGGATCT ACTTTCACTT TCGCTCTTGG ATAGGGAAAC 600
CTTTACACAC AGACATCAAT TAGCCTATAA ATAATTAATT TTGTTTGTTT AGCGCAAATA 660
TTTGTTTCAA AACTATTT 678