EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-12460 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:2987954-2989320 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr18:2988241-2988252TAATCCAATCA-6.02
Foxd3MA0041.1chr18:2988843-2988855AAACAAACAAAC+6.32
KLF13MA0657.1chr18:2988394-2988412AAATGGGGGGCGTGGCAT+6.78
KLF14MA0740.1chr18:2988397-2988411TGGGGGGCGTGGCA+6.57
KLF16MA0741.1chr18:2988399-2988410GGGGGCGTGGC+6.62
NRF1MA0506.1chr18:2988488-2988499GCGCATGCGCG-6.02
NRF1MA0506.1chr18:2988487-2988498TGCGCATGCGC+6.32
POU4F1MA0790.1chr18:2989217-2989231ATTCATAATTAATA-6.14
POU4F1MA0790.1chr18:2988079-2988093ATGAATAATTAATG-8.42
POU4F2MA0683.1chr18:2988079-2988095ATGAATAATTAATGTA-7.06
POU4F3MA0791.1chr18:2989217-2989233ATTCATAATTAATACA-6.02
POU4F3MA0791.1chr18:2988079-2988095ATGAATAATTAATGTA-7.67
SP1MA0079.4chr18:2988398-2988413GGGGGGCGTGGCATA+6.23
SP3MA0746.2chr18:2988398-2988411GGGGGGCGTGGCA+7.04
SP4MA0685.1chr18:2988396-2988413ATGGGGGGCGTGGCATA+6.28
SP8MA0747.1chr18:2988398-2988410GGGGGGCGTGGC+6.44
ZNF24MA1124.1chr18:2988073-2988086GAATGAATGAATA+7.52
Enhancer Sequence
ATGTGTGTGT GGATGTTTCC CAGAGATGGG TTGCGGCTGG AAGGGCATCC GCTTGCTGGA 60
TAAGTTGGCG GTTCATTCCG CTGTGGCGAC CCTGGTTAGT AAAGGGACTA AGCCAACAAG 120
AATGAATGAA TAATTAATGT ATTTAATGAT ACTCAATCCC CCTTTCATTT TTGACTTGTA 180
GAATAATAAG TCTTCTGTAC CATTAATTTT TCTTTTACTT AGCTATAATT AATCCACTTG 240
TGAATTAATG AATTAGAAAA CACCTCACTG ATACTACGTC AACAAATTAA TCCAATCAGC 300
TGTCAGCAAT GTCCATGCAA ACCAGTAATA ATGAAGTGAC GTTCGCATAC GCGGATCCAA 360
AATAACAGCG TTAGCATCAT GATATTCACA TTCAACGACT GCCACACGAC ACCAATGTGT 420
TCACAATTAA TACAGCCTAC AAATGGGGGG CGTGGCATAA ACCGTCGCGC GTAAACAAAT 480
CAGTGTTATT AGTACAATAA TCATAATTTA GCATAGGAAG TTTGACAGCG GCCTGCGCAT 540
GCGCGCTGTG CGCCTACCGT CTCATCGGTG TTTATAATCT GAATCTAAAA CGTATCAAGC 600
CAATTAATCG TTCAATTCTG AAGTGTCTCA CTGTTTACAT CTGACCCAGA GCACGATGAC 660
ACCCTTAGAA GTGTGTTTAT TAACCCCGAA GCTATTCATG TTTGGAGATG AGTCTTAATT 720
ATATATATTT TTCCACTAGC AAAGGGAGGA AAACACATGA CTCTTTTAAA ACACACTGCT 780
CACACGCTCC GTCTGAAAAC ATCAGCGACT CGATCGCCAT CCAAACAAAG ACTACAAGGC 840
TTAAAGTTTG AGTGATCCAA CCCGAGATGA GCAAAGATGA TGAGGAGCCA AACAAACAAA 900
CAAGCAGAGC AAACCGCGCA GCTCACCCGC GGATGTGTCC TGTAAGTACC GCTCCAGCTG 960
CGGGAAACTG AGCTCGGGCA GATCCAGAAC CGGGCCGTAG CGCTCCAGAA AGGAGCAAAC 1020
CACCGCAAAA CCGGGGCTGT GGGCTGGAGC GAGAGCCGCC GTGCTGGTGG TGCCCGGAGC 1080
AGCCATCTTT CCTGGAGATG ACGAGCTTTG CTTAGACCCA AAACTGCCCA CAATACACCG 1140
CGACACCCAC CCAGAGCATC ATCCGGAGGG GCAACTCGCG TGTACGGCGC ACCACAATGC 1200
CACCGGCATC ATCATCATCA TCATCATCAT CATCGTCGTC GTCGTCATGA GCATTATTAT 1260
CTTATTCATA ATTAATACAT TTACAGTATT TTCGTTTTTG AATGCCAAAC GTGCATGATA 1320
ATAAGGAAAT GGGAGAATTA TATAGAGTAA AGATAACATT CAGAAG 1366