EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-12439 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:1653943-1655014 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr18:1654047-1654068AAAAAGAAAACGAAACCTATT-6.19
IRF9MA0653.1chr18:1654049-1654064AAAGAAAACGAAACC+6.02
ZNF384MA1125.1chr18:1654143-1654155TTTTTTTTTTAA-6.44
Enhancer Sequence
CGCGCCATAT TAAATGATGC ACTGAGAGAG CAAGAGCGCG CGCAATGATC CGTTCAAATA 60
GATGTAAAGT TAACACAAAC TGTAGCTGTA GGTCTACATT TTTAAAAAAG AAAACGAAAC 120
CTATTTATCC GCATTACAAA TACAGTAACG TTAGTTATCG CTGAACTTTA GTGGCGCTTG 180
TTGTGACGAA AATATGCGTG TTTTTTTTTT AAGATTTACT TTTATGAGAT CACCTGCAGG 240
AAGCAGGTGA GGAGATCAGC TGTGATTCGG TCCGGTGTAA CACCGGCGTC AGCGAGCGGC 300
TCATGACCAG ACCAGTCGTT TTTTTTCTCC ATGATCGCCG GGGCAGCAGC AGTTTTAACC 360
CGCCGAGGCT TTTAGAACAT TATAAAGCAG TTTCAGCTCA AAATGGACCC GTGAGTGTCG 420
TAGGTAATTT AGGATTTCGA TGCGATTACG ATTCGTGTCA CTGTATGAGG CAGATACATA 480
TTTACACATG ATGCTAAAGT GTGCTTATGC TAACAATCCT TATGAAACTT AAAGTTAAAC 540
TTATGAAAAT GCGAGAGATA TTTAATTAAC TCATTTATTT GTTTTATATG CTATTTGTCT 600
TTTCTTTATG CCGTTTTGAA GGTTTATTCC AGTGTTGCCG TTACGTTATA GAGTGTTTTG 660
TATTGCTGTA ATGACAAATA AATCTGACCA GATGCGACTG AATATGTGTG ATGGATAACG 720
TTAATGATGA AGTGGTATAA CTCGTACAAC CAAGCACAGA AACATCCCTT TGTTTGCTCA 780
ATATCACACA AAGGCATCAA CAAGCCTTTG TTATAAGCAA ACTTTCTGTA AAGAAACAGG 840
CTTTGCCAAA CCTGTTAGTT TGCATTTTTA AAGAAGGTTT CACTAATTTT TAACAATTTA 900
GGGCAAATCA ATTTGAACAA TTACAAGGTT GTTTAAAATG TAGCACACCA TTAGAGTATT 960
GTGAGTGGCA TATTTGGTTT GTAATATCAT TATACCCTTT ATTTATTTTT TATTTCAGAC 1020
TACCAGTTTG TGAGCTGATA TGCAGTGGAA ATGTAAGTTT TGCACTTACA C 1071