EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-12433 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:1252381-1253808 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hmx2MA0897.1chr18:1253039-1253056ATGTATTAATTGCTATT-6.53
Hmx3MA0898.1chr18:1253039-1253056ATGTATTAATTGCTATT-6.23
Lhx3MA0135.1chr18:1252431-1252444AAATAATTAATTA-6.71
MEOX1MA0661.1chr18:1253169-1253179GCTAATTAAC+6.02
POU4F1MA0790.1chr18:1252429-1252443TTAAATAATTAATT+6.01
POU4F2MA0683.1chr18:1252429-1252445TTAAATAATTAATTAA+6.25
POU4F3MA0791.1chr18:1252429-1252445TTAAATAATTAATTAA+6.3
Enhancer Sequence
AATGCTACTT TTATCCTTGA AAATAAGCGT TCGCAAAATC AATTTAGTTT AAATAATTAA 60
TTAAAGTAGT GAAAAAAAGA TTGGGGGAAA TGAAAATCGT TCGCTTTACA CCAAAAACTA 120
TTTCAACAAA TTATTATTGT TATTCAATTT CTTTTCGGCT TAGTCCCTTT ATCAATCTGG 180
GGTCGCCACA GCGGAATGAA CCGCCAACTT ATCCAGCACG TTTTACGCAG CGGATGCCCT 240
TCCAGCTGCA ACCCACCACT GGGAAACACC CATACACTCA TTCACACACT ACGGCAATTT 300
TAGCTTATCC AATTCCCCTA TAGCACATGT CTTTGGAAAA CCGGAGCGCC TGGAGAAAAC 360
CCACGCGAAC ACGGGGAGAA CATGCAAACT CCACTTAGAA ACGCCAACTG ACCCGGCTCG 420
AACAAGCTAT CTTCTTGCTG AAAGGCAACA GCATTACCTT CTGCATCACC ATTATTATTA 480
TTATTATATG TAATAATGTT AATATTTGGC ATTTTTATTC CACAGCAATT TACAAATGAA 540
AACAATAATC AAAGCAACAA TATAACAAAA ATGTGAAATA TTAAAACTCC TAAATGGTCT 600
TATTCTGTTT ACAACATGCA TACATGTATA TACAGTGACA TTTCCGCCAC TAAAATCAAT 660
GTATTAATTG CTATTTATCT GGAATTGTTT TAAAATAAAC AGGTTATCAG CATTATTCCT 720
GAGCCCCATA TCGAGCAGCC ACCTTCACGC ATGCGCACTG TGCGCGTTTA GCAATACAAA 780
TATCAACTGC TAATTAACTT TCTAAGGCTT GCGAGTTACG CCTTTATTCG TCGGTTTACC 840
ATCTTCCTGT TATATATACA CGGACACTCT GTGTATTTAC ACCAAGAACA GCACAGTTCT 900
GTTTATATTT CTGTAAGTTA ACGTTATTAG TACGCGATTC AAAACTTAAC CGTCAGTCAT 960
TTAATCCTCC GCCTCCATCT TCATTTTTTA TTCATCCGTT TTACTCACGT TGTTCTCGGA 1020
AATAAACGCG AGCATGGAAG GTGATTGTTC ACACAAAGAA CAAGCCAAAA ACACGACTAT 1080
TGCTGGCTGT GTATGGAAAC TACGGCGATA CGGACGATTT CTGCCCTCGG GAAAAGCAAA 1140
ACCGAAGACC TCAGGTGATA ACAGCGCGTG GAAGGTGAGT GAGGAGAACT GAAATAAGAG 1200
CCCCGCCCTT TATTTTGCCG CCCGCGGGCA AATCAACGGA AGGGACAACG GGACAATCTC 1260
GTTTTAAAAT TTTAATATTT TTTATTAATT TATTCATATA TTTCAGTATA CAAACTCCAA 1320
TGTTAATGCT TTTTTACAAG TTAGTTTAAA ATTGTTGGTG CTTCTAAAAA GGAGAACAAG 1380
TTTAACTTGA CAAGATGACA GACATAGCTA TTAGTATAAC TAATAAA 1427