EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-12408 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:110022-111009 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr18:110500-110511TATTGTTTATA+6.32
RFX1MA0509.2chr18:110245-110261CGTTGTCATGGAAACG+7.24
RFX1MA0509.2chr18:110245-110261CGTTGTCATGGAAACG-7.25
RFX2MA0600.2chr18:110245-110261CGTTGTCATGGAAACG+6.93
RFX2MA0600.2chr18:110245-110261CGTTGTCATGGAAACG-7.03
RFX3MA0798.1chr18:110245-110261CGTTGTCATGGAAACG+6.74
RFX3MA0798.1chr18:110245-110261CGTTGTCATGGAAACG-7.01
RFX4MA0799.1chr18:110245-110261CGTTGTCATGGAAACG+6.51
RFX4MA0799.1chr18:110245-110261CGTTGTCATGGAAACG-7.14
RFX5MA0510.2chr18:110245-110261CGTTGTCATGGAAACG+6.23
RFX5MA0510.2chr18:110245-110261CGTTGTCATGGAAACG-6.44
RUNX1MA0002.2chr18:110705-110716CTCTGTGGTTT+6.14
Enhancer Sequence
ATATAGTTAT TAATAAAAGC AAAGTTTAGT ATATAAAACT ACAAGAGGTT TTAAATATAA 60
CAGGTTATTA TTAAAAAACA AAACAAAATT AAGTTTAAAA ATCAAGATTT AATATTAAAT 120
GTCATTATTT AATATGTTTA TGAATTGTTT AAATGTTTAT GTAAATACTG CGTGACTTTA 180
AAGTGTCCAT TACCGAGCCC CATTCAAGCA CTGCAGCAGA GAGCGTTGTC ATGGAAACGG 240
AGCAACGACA CGACACCTGA CCGTCAACAG CACTTTTCTC ATGCGGCAGT TTTCACTAAT 300
TTCAGGTAAG TTTAGTCGCT AAAATCACGC AAATGTTACA TATAACTGTT TCTGACACTT 360
TTCTTACTGG TAATTGACAT ATTTCTGTTG AACATGTTTT TTATAGAGAC TGTTGTGTCT 420
TTGGAAAAAG TCCGTTAGAG TCTTAGCAGA GGTAACGTTA GCATTAGGCT AAGTTAGCTA 480
TTGTTTATAA AAGTGTTGGC TTTTAATTAC ATTTTATGTG TAGATGAGAA GTTTGACAAT 540
GTTTTATTGG AGGTAGTCTA CTTTATTTAG CCTAAAATAA GCACTGTACT GTCAACAAGA 600
GCGAATTAAA ATGTTAAAGT TAGTACATAT GTGTTACTTT GATATTTCAC AGTAATGTAA 660
ACTAATATTC ATTTTAAAGA GTGCTCTGTG GTTTCAGGAG TGACAAAATT ACCCCTACAA 720
CAGAAGAGAA GAGCCAAGAT GAAGGGAGCT AATCACAGAG CTGGAGGAAA CACAGGTAAA 780
ACTATAATTA ACTGTTAAAT AGATTAATGT GCATTTTTAT AAGAAATCCC TACATTATCA 840
TGCATCTGAT ACATGTCTTG ATTGCAGTTA TTTTAAAGTT TTGACATCCA AACATAAGTG 900
AGTGGTTTTA AACAATTTTT TACATTGCTT TTCTCAAAGC AGAATTTACA GCGTCAGTGC 960
TCCAGTTCAA AATGTAATAT TGTATTC 987