EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-12213 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr17:46825284-46826808 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr17:46825708-46825718TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr17:46825708-46825718TCTAATTAAA+6.02
HOXD9MA0913.2chr17:46825324-46825334GCAATAAAAC+6.02
RFX1MA0509.2chr17:46825644-46825660CGTTGCTATAGCAACT-6.46
RFX1MA0509.2chr17:46825644-46825660CGTTGCTATAGCAACT+6.47
RFX2MA0600.2chr17:46825644-46825660CGTTGCTATAGCAACT-6.91
RFX2MA0600.2chr17:46825644-46825660CGTTGCTATAGCAACT+6.95
RFX3MA0798.1chr17:46825644-46825660CGTTGCTATAGCAACT+6.4
RFX3MA0798.1chr17:46825644-46825660CGTTGCTATAGCAACT-6.77
RFX4MA0799.1chr17:46825644-46825660CGTTGCTATAGCAACT+6.31
RFX4MA0799.1chr17:46825644-46825660CGTTGCTATAGCAACT-6.51
RFX5MA0510.2chr17:46826336-46826352GGTTACCATGGTATCG+6.05
RFX5MA0510.2chr17:46825644-46825660CGTTGCTATAGCAACT-7.22
RFX5MA0510.2chr17:46825644-46825660CGTTGCTATAGCAACT+7.28
Enhancer Sequence
TTCTTCACCC ATGTGGGACA TGGACAATCT CCTCCAACCT GCAATAAAAC AGACAAATAC 60
AGACAAATAT AAAAAATAAA TGTAAAACAA AGTAAAGAAA AAGAAAAAGA AGAAAAAAAA 120
CGAAATAAAA AAAGAGCAAC AAAGTTGTTT AAAAAAATAA TCAGAAAAAT AACGAAAAAA 180
AGATGATTAG AGAAATTGTG CTCTTTAAAA TAAGTCTTTT TCTCTCAGAA ATCCTCCAAC 240
AGCTTCAGAA ATCTCAGGAA TCGCACAGAA ATGCTCTGCA AAGTCGCCTC GTCTCTCAAC 300
CAACAGATTG CGATGGGTTT GATTGTTTTT ATATGCAGTC AGAAATCATA TCATAACAAG 360
CGTTGCTATA GCAACTAACA TTGTAAAATA CAAATAGCCA AAAAGGGGTA TAAATCCGAT 420
TAGTTCTAAT TAAAAGCTCT TGTTATTAAA TTAAAAATGT ATAAAAATTT AATTTCCGGC 480
ATAATTTTCA ATAGGCCAAT CAGCTTTCAT CAACACTGCG TCATCAACAT ACACTGATTG 540
AGCTATCGAA ATTAAATTAA ATGAAATACT AAAAGCCTTA TTTAATTTAA TATCATTGTT 600
GTTTATTATA CAATTTATTT TATTTAAAAA TATAATTCAT TAATATACCT AAATTGTGCG 660
TTCGCCATAC ATTTATTACG CAAGGAGTGA CGTCAGGGAC GTCAGTCACA TGACCTTTCG 720
TAATGCCCTG CTTCAGCGTC CCAGCCGGCA CACGACCGAC CTTCAACGTT GAAATATGGT 780
TGAAATAAGG TCAGATGTGT TTTGAACGTT GAAATAATGT TGATAGAACG TTTAATGTTG 840
AACGGTTGAA AAACAGCCTG CATATGACAA GGCTTCAACG TTGAAATGTG GTTGAAAATA 900
CGTCAGTTGT TGCTTTAATG TTAAAACAAT GTTGAATGAT AAATGGTTGA AAAAAGTTAC 960
AGAAATCCTT GTACAAATCA ACGTTGACAT TTTTTTATCA TGGTCTGTAT GTTGAATTAA 1020
CGTCATGGCT TCACCCAATA TTCAACATGT TTGGTTACCA TGGTATCGGA GGACTCGGCG 1080
CACGCGGCCA CGCGCAGCGC TTCACTTCAC TTAATTACGA ACACCTGACC TGCAGTGCAG 1140
CAGAATTCAG AGGTAAGCGT GTTTTTAGAT GCTTTAAAGT TTTATTTACC CCCCGATTTT 1200
GCTTTACACA CATCTTAAAT GTGACTTGGT GTAGTGTTTC GAATTTTGAA GCATTTAAAA 1260
CTTTCCAGTT TGTTTTTAGT CTTGTTTGCG CTCCGGTGAT GCAGCTAACC TCGAGGTAAT 1320
GTCACATGTT TAACGTTAGT CTAAATGAGC GTTTTTATGG CAAATTCAAA GCGATAAACT 1380
CCAAACGCAG TTTAAAGTTA CTGAGCAACG TTATAAAACA ATATCCATTT TATACGCTGT 1440
ATTATTAGTG TTATTATTAC AAAGTGAACT GCTGTCGTTT CACTGTTGTT GTTGTTTTTG 1500
CTTTTAGACA TGTAACTTAC TCCA 1524