EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-11692 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr17:28685090-28686304 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF13MA0657.1chr17:28686167-28686185GAGCCACGCCCATTTTAC+6.81
KLF14MA0740.1chr17:28686168-28686182AGCCACGCCCATTT+6.42
KLF9MA1107.1chr17:28686254-28686267AGTGGGTGTGGCA-6.54
Klf12MA0742.1chr17:28686168-28686183AGCCACGCCCATTTT+6.22
POU3F1MA0786.1chr17:28685750-28685762TTATGTTAATTA+6.04
POU3F2MA0787.1chr17:28685750-28685762TTATGTTAATTA+6.07
SP4MA0685.1chr17:28686166-28686183CGAGCCACGCCCATTTT+6.24
ZNF384MA1125.1chr17:28686130-28686142TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr17:28686131-28686143TTTTTTTTTTAA-6.44
Enhancer Sequence
AGGGGTTTTA TGTATGATCA CTTTTATATA TATTAACATC AGATACCTGT CCTGATCCCA 60
GGGGTTTTAT GTATGATCAC TTTTATATAT ATTAACATCA GATACCTGTC CTGATCCCAG 120
GGGTTTCATG TATGATCACT TTTATATTAT ATACAGTAAC ATCAGATACC TGTCCTGATC 180
CCAGGGGTTT CATGTATGAT CACTTTTATA TTATATACAG TAACATCAGA TACCTGTCCT 240
GATCCCAGGG GTTTCATGTA TGATCACTTT TATATATATT AACATCAGAT ACCTGTCCTG 300
ATCCCAGGTG TTTCATGTAT GATCACTTTT ATATATATTA ACATCAGATA CCTGTCCTGA 360
TCCCAGGGGT TTCATGTATG ATCACTTTTA TATATATTAA CATCAAATAC CTGTCCTGAT 420
CCCAGGTGTT TCATGTATGA TCACTTTTAT ATTATATACA GTAACATCAA ATACCTGTCC 480
TGATCTCAGG TGTTTCATGT ATGATCACTT TTATATTATA TACATTAACA TCAGATACCT 540
GTCCTGATCC CAGGGGTTTT ATGTATGATC ACTTTTATAT TAGTTAACAT CAGATACCTG 600
TCCTGATCCC AGGTGTTTTG TGTATGATGA CTTTAAATAA AAATAGAAAA TAAATATGAG 660
TTATGTTAAT TAACTAAGAT CGAGAAAGAA AAATTAACCA CGATTTATTA CAGAAAATGT 720
GGTATTTATT TGTTTAAACA TGACTGAATA CCATATTTTA AACTACAAAA ACACGGTTAA 780
TCTTACCACA ACCATTATTA TTTGGTTTAA AATGGAAGTA AAAAAGCCCA GAGACAGTAA 840
AACGGAGTAA AACGAGGTCA GCCGTTTTTG CTAATGAAAT CTTTAAAATA TAACATTATA 900
AAACCAAAAA AATAACCTGT ATGATTGTTT TTTCCCTCGT TATCCACCGC GGTAGGTTCT 960
TTATCCATTA TCATCCTGTT TGAAATGACC GCGCTAAAAA AGAACCTGTA CTGCGCATGA 1020
TCGGTGACCT CTCAGTATTG TTTTTTTTTT TAAGGGGGCG TTTCCCAAAC ACCGACCGAG 1080
CCACGCCCAT TTTACGTCGT GGTAATGAAA CCCCTGGAAT TTAGTGCATG CCGGTGAAAA 1140
TTCACGTTTG TTATAGGTTT TGGGAGTGGG TGTGGCAAAA TGGCTTGACA GCGCCACCTA 1200
TGTACTTTTG ACAG 1214