EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-11620 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr17:25332361-25333071 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr17:25332435-25332448AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr17:25332434-25332447AAATTAATTAATT+6.92
POU6F1MA0628.1chr17:25332436-25332446ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr17:25332436-25332446ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
GAGCACATTT AAAAACGACA TACAAAATCT ATACTTGGCC TATATATATA AACCAAATAT 60
GTAAAACAAA TTTAAATTAA TTAATTACAA TCAGAAGCAA GAGACAGAAG GTGATTTTTT 120
TAAAATGAGA CTTAAAAGCA CCAAGGGAAG AGCAAGAGCA AAAGCTCTGT TTCCTTTTGA 180
TTTTAACCGT GATTTGGAAA CAACAGGTTT TTAGACCTAA TCCAATGAAA CCTGCCAATG 240
AATTAGCCCA TCAAGTAGGT TCCTGACCAA TCAAACTTTT ACATTTGTTT TTACATGCAT 300
ATTTTGGACA TGACTAGACA TTTGGTTATA TAACAGATAA TACTGTGCCA TGTTCTGTAT 360
TTCACAATGC AGTGTGCTTT ATTTTACCGT TTATTTGTAG CTATAGTGAC CTTTGGGGTG 420
CAGATGCTGG ACTGCAACGC TATTTCACGA TACAACATTC TAACTGCTTA TCAGTCAACT 480
CGTCCTGAGA GTGGCGCTCC AATGACAGTA TTTGAAGAAC CTCTCAAAGT TAATAAAAAC 540
TCGAAATTAC GCTAGAAGAT GAGATGAAAC AGTACAACTT AAATGTTTCA CATCTTGTAA 600
TCGCTGAATC AGTGTTTCAG TGTTTCAAAT TTGTCAGTAA AACAGCTTGT AAACTACGTC 660
AAATATTTAC CTCAGCAAAT CCATTCAAAC CTAAATATCC TAGAGAATAT 710