EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-11202 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr17:6499656-6500788 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr17:6500281-6500291AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr17:6500281-6500291AGCAGCTGCT-6.02
BHLHE40MA0464.2chr17:6499694-6499704GTCACGTGAT-6.02
POU1F1MA0784.1chr17:6500017-6500031AATATGCAAATAAA+6.34
POU2F1MA0785.1chr17:6500017-6500029AATATGCAAATA+6.37
POU2F1MA0785.1chr17:6500077-6500089AATATGCAAATA+6.37
POU2F2MA0507.1chr17:6500078-6500091ATATGCAAATATA-6.3
POU2F2MA0507.1chr17:6500018-6500031ATATGCAAATAAA-6.98
POU3F3MA0788.1chr17:6500017-6500030AATATGCAAATAA+6.04
POU3F3MA0788.1chr17:6500077-6500090AATATGCAAATAT+6.05
POU5F1MA1115.1chr17:6500018-6500029ATATGCAAATA+6.02
POU5F1MA1115.1chr17:6500078-6500089ATATGCAAATA+6.02
RFX5MA0510.2chr17:6500347-6500363GATTGCTATGGCAACT+6.21
RFX5MA0510.2chr17:6500347-6500363GATTGCTATGGCAACT-6.2
SOX10MA0442.2chr17:6500274-6500285AAAACAAAGCA+6.02
SREBF2(var.2)MA0828.1chr17:6499694-6499704GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr17:6499694-6499704GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr17:6499694-6499704GTCACGTGAT-6.02
YY1MA0095.2chr17:6500306-6500318CAAAATGGCGGA+6.11
Enhancer Sequence
TGCGGCACAC TTGGTTACTA CGTCAATTAA GAGCGCGCGT CACGTGATCT GCACGCTTGG 60
TTGTTCAAAA GTTTACTTGC GTAAAAACTA ACTATTGCCA TTGTAATATC ATTATTATTG 120
TAAAGGTTAT TTTCACGTGC GTTATTAAAT ATATAAGCTT TATAGGCCTA TAAAATAATA 180
ATAATAATAA TACAAAAAGA CTATTTACAA TGTTTATAAG TCCACATATT ATATAATTGC 240
ATTTGTAAGC ATCATAATAT GGATAATACG AAACCCCCAA GAACAATAAA TAAATATGCA 300
AGTATATGAA TAAATGAGTA AATAAATCCA TAAATTCCTG CATAAATAAA AATAATAAAG 360
AAATATGCAA ATAAATGAGA AAATAAGTCT ATAAATTCGT GCATTAATAA AATAATAAAT 420
AAATATGCAA ATATAACTTG TATGCTCGAC CGTAAACTTT TAAAGTACAG AATTTCATGA 480
AAACAATGTT TATTATATTA CAAATTAACT CTATAAACTG TTAAAAAAAG TGCAGATTAT 540
CGCTAGTCTT TTGAAGTGTC TTACTGGCGT CTTTCTGGTT GTATTTCAAC TTTAATGCAC 600
CTTTTCAATA GAAAAATAAA AACAAAGCAG CTGCTAAGAG CCAATGGATC CAAAATGGCG 660
GAATCGCTGA GCGCTGCTCA AACACGCGTT CGATTGCTAT GGCAACTGTG GAACGTTAGA 720
ATGATGCTCG GGCAAAAAGA ATTTCTTCAG TTCATTTCGA GATAGCCGTT CAGTACAGTT 780
AGTAATCGAT ATTAGTGCTA GACGGTAGAC GCTATGGCGA GCAAACAGAG AAATATGGCT 840
TTCGTCGACG ACGAATTACA TCACTCTTCA GAAACTCCAT TCACAGTTCA TGTTGAATCG 900
CTAATTATAG ATATGAACAT GGATGTTGAA GTTTCCAACT ACACTTGTGA GGATCAGGGT 960
GGCATGAATG CCTCTCCTGA ACCCACAGAA GACAACAACT CAACAGGTAA CTAACTTTCT 1020
TTCAAGTGAC AAAAGATATC TCAAATGTTT TCACTGAAAT GATCTGTTTT CTGAAAATAC 1080
GAAACTTTTA TTATGATTGA CCAACACACT GCAGAAATGT AGGACAACAG AG 1132