EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-11148 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr17:4348344-4349681 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr17:4348896-4348908AAATGTTACATT+6.52
LHX2MA0700.1chr17:4348709-4348719ACTAATTAAC+6.02
LMX1BMA0703.2chr17:4348936-4348947AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr17:4348937-4348950ATTTAATTAATTT-6.07
NFIL3MA0025.1chr17:4348675-4348686TTATGTAACAT+6.32
Enhancer Sequence
CATTGAGAGA CGGATTGTTG ATCGAACATG TTTAAAGCTG ATCTTACTGT AGTTGCTGAC 60
CCCACATTGA AAATGAATGG GAATTTTGTT TTAGATGAAT CTGTCCAAAA GAAATGTGAA 120
GTAAATAATA AATTATGTGT GTAAATTGCT GATTTTTTTC CTCTCAGATG GCAGAATTTT 180
ATTTCTAAAA TCTAAAACAG TATGCAGAAA CCTTTAGGTC AGACTTTTAG TGATTTTTCA 240
ATGAAAAGTT TATTTTTTTT AAGCAGATGG CTTATTTTAA TGCCGTGAAA CAATTAAACC 300
TCTTCAATAT GAGTGTATTT ATTATACAGG TTTATGTAAC ATGATGTACA TTATGATCCA 360
TGTTTACTAA TTAACAAGCA ATAATTTGAT CACACTTTAA TACAATTCTC ACTAATAATG 420
AACCTTTAAC TATGTGACTT TTCCTTTAAT AAACTGTCAA TTTGCTGTGT TCACTCAGAT 480
TAATCAGTGG TTTTCTTCAT TTCCCCCCAA TTATAACATT TATTGTGATT TGTGTTAATT 540
ATTAGGTAGT CTAAATGTTA CATTCACCAA CCCAAATGGG GTAATCTAAA ACAATTTAAT 600
TAATTTAGTA TTAATTTAGT ATTTTGGGAA ATTAATTTTG AAATATTCTC CGCGAACTGT 660
AAAGCCCGCC CTGTTTGATT TGATTGGCTG ACATTTTGAC ATTGACGAGC TGTTATTTCT 720
GAGGCAGACT CTGACAGGAG CTGTTGTGTA TTGATTACGG CCCGGTTTCA GATATGAAAT 780
CAGTGCTGGC TCGGTAATAT TCACTCATTT CTGTGCTGTT CTGAAGAATC TGAACTTTTG 840
AAAATAAACG CGGCTAGAGA CGCCATTCCA AAAATTCCAT AAGTGACGTC ACGCGGCTAA 900
CCACTCTCCA GTTCAGTGAT TATCAAGCTA GTGAAAGGAT TGTCATTTGA GCGCGTTTAC 960
AGAGTTTGAG TAAATGGATC GATTTACTAA TTATCTGTCG ACTTACAGCA CTTTTACGAG 1020
TGAAGTAGAA CAATTTATGA GTGAAAACAC GATGCCTGTG TTTGACCACG CGATGGCAGC 1080
AACAGCATCT GTGTGTGGTG GAATGGAGAA AGCGGAGGCA GGTTTGTGGC TCGACACAAT 1140
CGGCTTCTGC GACGACTTCT GTCCCTGGCT TGACCAGGTG GACGGGACTG TGGTTTCAGA 1200
GGCCGCTACA GCACTTCACA AGCCCTCTAC TGCTAATAAA GTGGAGAGAA ATGCAACCGG 1260
TGAGACTATC AGCAAACACT CANNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1320
NNNNNNNNNN NNNNNNN 1337