EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-11096 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr17:1919490-1921127 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr17:1920984-1921003TAGCGCCACCTGCAGGTTT-6.11
FOXF2MA0030.1chr17:1919759-1919773TCATGGTAAACAAT+6.14
MLXMA0663.1chr17:1920626-1920636ATCACGTGAT+6.02
MLXMA0663.1chr17:1920626-1920636ATCACGTGAT-6.02
MLXIPLMA0664.1chr17:1920626-1920636ATCACGTGAT+6.02
MLXIPLMA0664.1chr17:1920626-1920636ATCACGTGAT-6.02
SP1MA0079.4chr17:1920258-1920273AGTGGGCGGGGCTTC-6.79
SP2MA0516.2chr17:1920257-1920274TAGTGGGCGGGGCTTCG-7.49
SP4MA0685.1chr17:1920256-1920273GTAGTGGGCGGGGCTTC-6.82
ZNF384MA1125.1chr17:1921000-1921012TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr17:1921001-1921013TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr17:1921002-1921014TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
GGATCTAGAG AGTTGCATGT CTTACGGAAA GAATATAAAT AAATTGACCA ATATTGTAAA 60
ATATATTCTG TTTTATTACT CTCTACACAA ATGCATTGTC ACAACTGCAT AGGCCAAAGG 120
CTCTGAAATA AAATAACTAA CATTACTAAC TAAAAGATGT GCAAGTAAAA GACAAAATAA 180
ACTTGCCTAG TCCAAAATAA AAAGATGAAA ATGTTTATCA TGATTAATGA AGGCATGTTT 240
AAAAAATGCA GACCAAATAT TCAAAAGCAT CATGGTAAAC AATATAGGGA GGGTGTCACA 300
GGTTGTCACT GAATGAATGT GCGAATTTAA AACCAACTTA ACCTTAATAA ATATAAATAC 360
TATTAAAAAC AACAAACAAT GCGCAACATA TTTCCCCAAA ACAAGACATG GGAACACTGT 420
AAACAATATA AAACACACGC AAACTCCTTC ATATTCACAT ATATTGTCGT TAAAGACTAA 480
GAAAGCAACT GTTTGTAAGT TTGATGTAAC GTTACTTGAT GTTCTCTGCG GCTCCACGCA 540
TCACAAACAA CAGCTATGAG ACTGTGAATA AAGACAAAAG CACTCACCGA CTGAGTTCCT 600
TGTTTGTTAA GACGTCCAAA AGTTCATTTG CTCCTCGTGG ACATTTATAA ATGTTTATTT 660
TCTCCGGCTG CACAACTACA AGACTCCCAG CGTGATCATT CCATCTGACT GAACTCGACT 720
GAATCTCGCA AAACTGAAGC AGCGGGAATG AGTCAATCAA AAAACTGTAG TGGGCGGGGC 780
TTCGCCAAAA AGTTTCTTTT AAATAATTTT AACAAGTATA AATGGATCTT ATCAATATAT 840
GTGTGTCCAC GTAGTAGTTT TGATCCGATA TATATTAACA GTTTTAGTAT TATTTTCTAA 900
TTTAGACAAC TGATGAAGGA AAAGCGCGGT CATGTAATAG TCATTACTTT TCTCAGCGCT 960
GTCAAGATTG CCCAATCATC AGCTTTTGAT TACTTTTTTT CATACAGATA TCGTATTTAT 1020
GTGTATATGG AGGAACTCTA TTCTTATCGC TTAAAGACTA AATATGTTAC ACATATTTTA 1080
GTAAATATTG AATTGGAAAT TATTATTAAA AAAGCAGACT AACCAAAAAT ATAACCATCA 1140
CGTGATTGGG TTAGACCAAT CACAGGCGAC TGTTATCATC TTAACGAAGA GGCTGGAAAA 1200
TCACATTTTT GTTTATTATT CAGATTTGAT ATATGGAATT ATTAGACAAA ATATATAATA 1260
TAAACACATT CTAGGGTTTA TGTGTGTCGT GTAATTAACA CTAAATCTCT TAGTTAACGA 1320
AAAAGGAATC GTTGTTTGCC TCAAAACTAG GAAAAACAAG GTTTGTAGTT TGTGTTTGTC 1380
CGTTGTGTTG TAAAGGAAAG TTTAATTTAA CCAAATATGT CTATATAGTG GCTGTTAAAC 1440
GTATTAAAGC TGTATAATTA ACGCTGGAAA AACGATTGTT TTGTGTAAAG TTCATAGCGC 1500
CACCTGCAGG TTTTTTTTTT TAAATACAAC GACCTGTTCG TAATACACTC ACCGGTCACT 1560
TTATTAGGTA CACCTGTCCA ACTGCTCGTC AAATTTCCAA TCAGCCAATC ACATGGCACC 1620
AACTTAATGC ATTTATG 1637