EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-11054 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr17:321708-322704 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF2MA1465.1chr17:322651-322665GAATGACATCATTA+6.65
Arid3bMA0601.1chr17:321715-321726CTAATTAATAT-6.02
JUNMA0488.1chr17:322653-322666ATGACATCATTAA-6.57
JUND(var.2)MA0492.1chr17:322652-322667AATGACATCATTAAT-6.43
Nkx3-2MA0122.3chr17:321766-321779CTTAAGTGTTTAT-6
PBX2MA1113.1chr17:321988-322000CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr17:321985-322002GCACCTGTCAATCACAA-6.11
POU4F1MA0790.1chr17:322395-322409CTGCATAATAAATG+6.04
POU4F2MA0683.1chr17:322395-322411CTGCATAATAAATGAT+6.7
POU4F3MA0791.1chr17:322395-322411CTGCATAATAAATGAT+6.18
Enhancer Sequence
GTGTTGCCTA ATTAATATTT TATTTGAATG TATTTTAAAG TACTAATTTA AATTAATTCT 60
TAAGTGTTTA TTAACTTATA TTTGTTACTG AATATCTATG ATTGACATTA AAGGACTGCG 120
TGTGTGTGTG TACTGTGTCT CTTTAAAGTC TCTGCAGCTC AAGTGTCCGC AGCGCTGCCG 180
CTTTGCTTTA TGACACACTC CTAACGTGGG CGGGACTATT CCAACATCAT CCAATCACAG 240
CTGCGAAGAC GACCGCTGTC CTCTTTGATT GGTCAACGCA CCTGTCAATC ACAAGGTGAA 300
GCTCTGTCCT CCAGAACGCA CTTTATTCCG TGAGAGAGAG AGAGAGACGG ATCCGTCATG 360
AACATCAGAT GGGTGAGTAA AACATGATTA ACTTCATAAA ACACTCGATG ATTGATTTTA 420
AAACATCCAC GAGCCGTGAA AATAACCTGA CATTGTATAT TTATACGGAT CCCATCGTGC 480
GTGTTATGTT TGCATTACAG CAGAAAAAGA CGCAGAACTT AATGCTGTGT TTTATTTTAT 540
AATTGAACGA TTGATACAGA TGCATTGATC GCAATCACGT GTTTGCATTA GGGAAGATGA 600
ATTGTTGAAT GCAAAGTGAT CACATGGCTT TAAGAAATGC AGTGCATGTG TAAAGCATCA 660
ATGATGCAGC AGTGCAAAAA TAACTTTCTG CATAATAAAT GATGGTGCAC AATATGCACA 720
GTGCACCTCG TATAACACAC GCGCGCACAC ATACACACGG ATGTTGTTTT GGTTTGATCG 780
CTGCATGTTC GGTTTAGCCT GTGCATGGTC TCACATGATG ATCAAGTGTC ATTATAATGT 840
GTGTGTGATG GCTGAATTAT GATGAAGGGG TTTCTGGTCA CTCAGCTGCT GATTTAAATA 900
ATTATGCATC CAGTTCAAAG GCTTTGGCTA AATAAATTGT ACTGAATGAC ATCATTAATA 960
ATCAACCTAC TGTTAGTGTT TGCCAATGTG GATTTA 996