EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-11049 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr17:111493-112431 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Atoh1MA0461.2chr17:111518-111528AACATATGTT+6.02
Atoh1MA0461.2chr17:111518-111528AACATATGTT-6.02
BHLHE23MA0817.1chr17:111517-111529GAACATATGTTT-6.37
CDX1MA0878.2chr17:112289-112300GGTCATAAAAC+6.02
CDX4MA1473.1chr17:112289-112300GGTCATAAAAC+6.02
HLTFMA0109.1chr17:111836-111846ATATAAGGTT-6.02
NKX2-3MA0672.1chr17:111849-111859ACCACTTGAA+6.02
OLIG1MA0826.1chr17:111518-111528AACATATGTT+6.02
OLIG1MA0826.1chr17:111518-111528AACATATGTT-6.02
Enhancer Sequence
CATTTAAAGA GTGTGATTTT CTTTGAACAT ATGTTTAAGC AAAACTGCCT AAAATTATTG 60
TTTGCTTGGT TTTTTTAACT GTATTTAATG TATTAGTTGG CTTGTGGCTA CATTAAACAA 120
TATGACCTTA ATATTCAACC ATACAAGAAT CAAACAGCAC CGTTGTTTCT GGCATTTAAA 180
AGAACAGTTC ACCCAAAAAA TGTCAATTCT GTCATCGTTT ACTCATAAGT TTCAAAGCTG 240
TTTGAGTTCC TTTTGTGTTT GTCAGAAGGT GGGAAGATAT ATTGAACAAT ACAGAAAAAC 300
AGTCATTGAC TTCCGTGGTA TGTGTTCAAC AGAAGAAAAT GCCATATAAG GTTAGAACCA 360
CTTGAAAGCG TGTAAATGGT GAAGAAATTT TCATTTTCAC TTTGAAGCCA TTCACACCTC 420
CTGTAGGGTG TACAGATTGT TTTGCATTGA GACGGTGTAA ATGGTGCCGT TATTTAAGCA 480
CATCAGCGCT TTTGTTTCCA AATTACACTG AGATAAGGTT GGTTTTATAT TTGCACATAA 540
GATCAGTGAC CACTTGTGAC ATGCTCCCTA TTATTTTTTA TCATGCTAGT TTGAACAGTG 600
GATCTGAAAT TTTATGTAAG AGTGACTTAA AAAACATTTA CTGTGAACAA TGTTGTACTT 660
TGACAGCCAT TGTCTGATAA TACGATTCGC AAAGAATACT TTTATGAAAT TACATTTTTA 720
AAGTGAAATA TAATTCCCCA ATACTGAAAA TGAGATCATG TCATGATATA AAATAGTGTA 780
ATTTATAGCT ATTCTAGGTC ATAAAACAGT CAGTGGAAGA AAAGAGAAAA GTATTAGCAA 840
GAGCTGCAAG CTTTGTCAAA ATTAATCCAA AATATCTGGA CACTTTTACA GAAGTAAGGA 900
AAAAATGTTT TGATTTGCAT GATGTTTTAA AAAATCAT 938