EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-11040 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:55293278-55294552 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr16:55293591-55293604AAAAACACTTAAT+6.42
PBX1MA0070.1chr16:55294090-55294102TTTGATTGATGT-6.74
Enhancer Sequence
AATCAATGAG GAGCTTAATT ATTCAGCTTT CAGATGAAAT ACGAGTGTTT AAATGACTGC 60
CCCTCATGAT TTACGCCCAT GGGTCCGGGT CACTTATTTA ACCAATTGCT AATCTGCACA 120
GACTTTATTA CATTATTCAA TATATTTTCC CACTCATTCG GTGATAATAA GATAAATTAA 180
CGTAGATCTC AAGTTTTTTA AATAATTGAT GGATTTGATT CAGTGTCATA AAAATAAGCA 240
AAAACCCTCA AAAATTTAAC TTGCCTTTTG CTGATATCTA CTTTATAATA GATCAATAGT 300
CTATCTGGCT TTCAAAAACA CTTAATCAAC AGATGCCATG TTATAGTTAA ACACCGTTAA 360
GTGATTCACT GAGAAGTTCT GCGCTCGCTG CCTGTCAAGT TCACTTACGT TATGCTAACT 420
TAGCTTGCTA TCCTCGGCCC GATCTTAATT TTGATTCTGT AAAATGTCTA AGAAACACAG 480
CGAAAATGGA CCTCATTGAA TCTCAACCTT TATTACAGCT CATGGAGGAC ATTTCTCAAA 540
GAGGGATTAA CAAAAGTCTT ACCTGAGACG GTGTGTGGGA GTTGCACAGA CATTTTGTTC 600
GGCGGGCTTT CTTCAGTTAG GATTTAGGAT CTCATCACGC AAGCGCACTG TTGTGATCGA 660
TGACTCTGGC TCGTTTATTA ATGCCTGTGA CCGCGGTGAT GTGTTTTGAC AGTGGAGTGT 720
CGCTGTTTGA TTCGTACTCT TCGTGTCCGT GGTGAAACTG TATTTTTCAC CAGAACTGTA 780
TGGTTCTGGT ACATTTGAAT GTATTTTTAA TGTTTGATTG ATGTTGTTTA ACCCTTGTGT 840
TGCTGTTTCA TACACACTGG GGTCATTTTG AGACCTCAAC TTTCTCTCTG TTTCAGCAAA 900
TGAAGTGATT TTTTAGTGAC AAACTATTTT GACGTATTTT GGGAAAAGAC TTTGGAATTT 960
AAAGTTTAAA AAAAATTAAT TTAGTGAAAA TTGGCTTTGT TTATGCTGTT GGCTGTTACA 1020
GGTTAAATTG CTTTATTTTT ATACTGTCGG TTCAGGCATA ACTAGAAGCT GTCTCAAATG 1080
AACATGCTGT TTTTAAAAGT AATTGGAGCT GGCTGCTCCG GCAAGGTCTA TCTTGGCACG 1140
GAAAAGCGGA CGGACAACAG GTAAGTCTAT TCTCCCTAGT CCAGTTTAGA GGACATCAAC 1200
TTTGGAGAAA TCATGTTTGA TTGCTCACTC ATGTTTTATT CTAATTTTCA TCCACAGTTT 1260
GCCATCAAGT TGAC 1274