EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-11001 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:54751219-54752757 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr16:54751604-54751614ATCACGTGAC+6.02
CUX1MA0754.1chr16:54751464-54751474TAATCGATAA+6.02
CUX2MA0755.1chr16:54751464-54751474TAATCGATAA+6.02
HOXC13MA0907.1chr16:54751637-54751648GTTTTACGAGC-6.14
MecomMA0029.1chr16:54752599-54752613TTTTATCTTATGTT-6.14
SREBF2(var.2)MA0828.1chr16:54751604-54751614ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr16:54751604-54751614ATCACGTGAC+6.02
TFEBMA0692.1chr16:54751604-54751614ATCACGTGAC+6.02
ZNF24MA1124.1chr16:54751261-54751274TATTCATTCATTT+6.42
ZNF24MA1124.1chr16:54751257-54751270CATTTATTCATTC+6.48
ZNF24MA1124.1chr16:54751253-54751266CATTCATTTATTC+6.5
ZNF24MA1124.1chr16:54751249-54751262CATTCATTCATTT+7.34
Enhancer Sequence
TTAATAATAA ATAATCCTCA GCAGGGTGAA CATTCATTCA TTTATTCATT CATTTTATTT 60
TGACGTTACT ATGAGGTTTG GGGTAGGGAC ATATGCTGAT AAAATCCAAT TTAATGTGTC 120
ATTTAATAAA TAAAATGGAT AATAATCGGT ATAATTACTG TTTGAAACTA CTGTGATGTA 180
TGGGTTTAGT GTTGGGGTAG GGACAGACAT TAAAAATACA ATTAATGGAT AGTTTTTTTA 240
AATGATAATC GATAATACTC GCTCCAGTTG TATTCATAGA CTCGTATCCC ATTTAGCAAC 300
AACCGTTGAA CGCTTGTATT CGTTTGTCTC ACCGTAAACC CGTATGACTG ACGCATCGAG 360
AGCAGCGCTG TGAAAAGTAA CGATTATCAC GTGACTTTAG TAGTACGTCA CTTTAGTCGT 420
TTTACGAGCC TTGATAAAGA TCGCACTGCT AATGGACGCT GAATATGAAT ATTAATAACG 480
GATTATGTGT GTTGTGGAGC GGCAGCAGCA GCAGCAGCTG GACTCGGGCG GCTGTAACTC 540
GTCTCCGCGC CGCTGGGTGT CAGTGCAGCT GCTGGATCCT CCGTGTGCTG CTGTCCGTGA 600
TGGCGGAGCA CAGCGGCGAC CGTCGATCCG CGCACTGACT GTAGAGCCCG ACCACCCCGG 660
TATCGATACA CCGACCGACT GACATACCGA CAGCCGCGGA GCCGGCATGA GCTGAAGCCG 720
AAGAACGGAT TGAGATGAAC GCCGAACTGA GCCGAGCCGC ACCGCTGCTG CTGCTGAGGT 780
GAGACCCGAA CCCGGCCGAA CTGAGCCGAG CAGAACCGAG GATAGCACGG ACATACAATA 840
TATGAAATAT CAAAACCAGC GCAGATATTA ATAACAAGGA TAATATTAAT AACAACGACA 900
GACGAGTGAG ATTTAAACAT GACGATTCCT CACGAGACCA GCAGAGCCAG CTGTGTGTGC 960
GCGTGTGTGC GCTCGTTATG GTGATATGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1020
TGTGTGTGTA CAGTACTTGT TATGGTGCCG TTATGATTTT GTATGTTCTC GTAGTAGTAG 1080
TGTTGATGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTATG 1140
TGTACGTGTG TGTGTATGTG CGTGTGTACA TGTGTACAAG GGCTTTTGTT GTTGTGAGTG 1200
TGTGTGTGTA CACATGTGTA ACGTTACAGT GGCTGTTGTA GTGTGGTGTG TGAGTGAGAG 1260
AGAAAGAGTG TGTGTGTGTG TGTGTACATG TGTAACGTTA CATGGTTTGT TGTTGTAGTG 1320
TTGTGAGTGT GTGATGTAGT GATGTTGTCT CTGTTTGTGT GTGCGTGCAT TTATTATGAT 1380
TTTTATCTTA TGTTTGTTGT CATGCCTTTA TTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1440
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGC GCGCATGTGT GTGTGCTTAT GCTTCTGTTA TGGTGTTATG 1500
TGTGTACAGT GCCAGTGTTG TAATGCAAAT ATGTTGTA 1538