EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10990 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:54567445-54568523 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA10MA0899.1chr16:54568168-54568179AGTAATAAAAA+6.14
ZNF384MA1125.1chr16:54568305-54568317GATAAAAAAAAA+6.02
ZNF384MA1125.1chr16:54568306-54568318ATAAAAAAAAAA+6.27
Enhancer Sequence
CAAAAATCGT CAATTTTAAC ATCAGGTCTA CTGATGATTT GTAACCCCAG AATTTACTAG 60
GATTAAGGTT GAGTAAGACT AGTACTTCCA TAGGGACACT TTAAAACACC AAATCTCAAA 120
TTATAACCTT ACAACTTTTC AGAATGACCA GATTTTCCCT TTCTTTAAGA TCCATTATTT 180
CCATGGGAAA ATGTAAAATA TTTATTCCTC TAAGACTTCT AACCCAGAAC TTTTCAGGAA 240
AATAAACCCT ACATGCCTTC CCCAGAACAT CTAGTGTAAA TGGCTGGTTT TAAAAATAAG 300
ATCTTCTGTA ACTCCTAGAA AATCTAACCC CAGAACCTCT GTAAGTAACC ACACTTCACT 360
CTTTTAGAAT ATCTCAATTT CATAGGAATA TTGGAACCTA TAAATATTTC AACCTTTAAA 420
TATTTCAACT TTACTGGTTC CAGTTTCCTC TTCAAAAATC TCAAATTTAA GTGAAAACAT 480
CTCAAGTATC AAGATTTCCT TTTGGTAGTG AGAATCCTTT CAAAAACAAA AGCCCTCACT 540
TTAAAGCTCT CACTTAAACA ATGAAAATCA CAGTTTGGTT CTATTGTGAA TTATTTTCTC 600
TCCACATAGC GTGATTGTAG ACGTTCACAA CTACACAAAA TAGCATAGAC CAGTGGTTCT 660
CAAACTTTTT TTTTTACCAA CTACCACCTT AGAAAATTGT CTCCAAGTAC CACCATAATG 720
GCCAGTAATA AAAAATAACA TTGTAGGCCT AATTAAGCTG TGCACAGTTT AAAAATGAGG 780
CAGATTAATT CCTATCATTA AGAATGTGTT ATTGTCAGTC ATTTATACAT TAAATAGTCT 840
GAACATTAAC TGTGCTTGCA GATAAAAAAA AAACAATAAA TTGAAATGTG CTCTTAAAGT 900
TCATTAAATG TCACTGTTCT AAAAGTAAAT AGAAAACTGC TGTACTTAAA TCTAAAGTAT 960
TCATAGTAGC CTATTCATCA AAAGCTGGAA ATGTTGATTG GACCTCATAA ATATTGGCTT 1020
TGTCATTCAT ACACTTTCTG ACAAATCTTG ATTTCTGACA AATATATGTT AAATGTAC 1078