EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10919 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:53035703-53036872 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PBX3MA1114.1chr16:53036194-53036211TTCTGAGTGACAGTCCT+6.08
PHOX2AMA0713.1chr16:53035959-53035970TAATTAAATTA-6.62
POU2F2MA0507.1chr16:53036770-53036783AAATGCAAATGAG-6.28
POU3F3MA0788.1chr16:53035950-53035963ATATTAGCATAAT-6.46
PROP1MA0715.1chr16:53035959-53035970TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr16:53035959-53035970TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr16:53035959-53035970TAATTAAATTA-6.62
RORA(var.2)MA0072.1chr16:53036397-53036411AATAATTAGGTCAC+6.16
RORBMA1150.1chr16:53036400-53036411AATTAGGTCAC+6.62
RORCMA1151.1chr16:53036398-53036410ATAATTAGGTCA+6.74
Enhancer Sequence
CAAACCAGAA TGCAAATCTC CAACACATGA GTGGCTGAAC TTGTCTTACT CACAGACTGA 60
ACTCCTGCTG TGCTTTTCCT GCTAAACATG AACAGAATGA TTGTTGCCTA GCAAATGTAA 120
TCATAAATGA AGAACTCTTC AGATTCAGAG AACTGGAACA TCGATTAATG AGCAACTTCC 180
ACTAAACCAC TTCATCCAGG AAACTCTTCT GCTATCAATA ACAACGCTGA CTAGCATTTA 240
TAGTATTATA TTAGCATAAT TAAATTAGCG TTTCACACTC TTTCGAACTT TCCTACAGCA 300
TTAATACGAC GAATATGAAT ATCTAAAACA ACTAGTAATG GGATTTTTGA CTAATTAAAT 360
ACATTAAAGC GTGTAAATAA TAATAAAAAT CACTTACATT CGTCATTGAA CGGTTTCCAG 420
CAGTGTTTTG TGGACCGACA TCTGCTGTGT ATCATCTGGA TCTCCTAGAG ACAGTTCGCT 480
GATCCATTGA TTTCTGAGTG ACAGTCCTAT TAAAAGGCGC TATTCAGTCA GAAATGTGCT 540
CATTTCGTAT ATTCAGTCCC ATATATGATG TGAAATCGTT ATATTGTTTA ATATTCGTCA 600
AGATATTGGC TAAAATATCT TCTTATGCGT GCGCGCTGTA CGCATTTGAC TTCAGCCGGA 660
GAAAATATGA ACGGTGTAAA CACAACTGTT GAATAATAAT TAGGTCACGC TCTGCTGCCG 720
TCCAATAGCG CGCGGCAGCT CATGAATATT AAGTAAGTCA CGCTGACGTT GGCTAATAAA 780
GTTAAAGCAG CTCATGAATA TGCAGTTTCA GAATTTTGCG ACTCGAAGCG TTTAAGAAGA 840
ATACACAAAA ATGTAATCAA ATGTATTTTT TTAGAATTAA TTTGACGTTT AAAACAAACA 900
GAATCAATTA GTATAAAAGT GGCATTAATA TCCCTGTAAA GTCTAACTTT GACTGTAATT 960
TGATAGGGAA ATGTTCAAAC AATGTGAAAA TGAGCTACTA GAGAACATGG AAGTTCTCTG 1020
TGGAGGATTG TAACTGTTAC CTGGTTACCA CTAGAACATG CAAAGCTAAA TGCAAATGAG 1080
ATCTCTATGA ATGAAGTATA AAGACACGAG TTTTACGCTG CAGACAACTA TGCAGAACAA 1140
CTTTAATTAT TCCCACTGGT TGCCTTAAT 1169