EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10834 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:49474617-49476639 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr16:49476394-49476413TATCCAGCAGATGGCAGCA+6.84
DMRT3MA0610.1chr16:49475978-49475989GTTGATACATT-6.02
FOXF2MA0030.1chr16:49476369-49476383TTTGTTTACCTTGC-6.45
Foxj3MA0851.1chr16:49476366-49476383GTGTTTGTTTACCTTGC-7.12
HNF1AMA0046.2chr16:49475366-49475381AATTAATGATTAATA+6.38
IRF1MA0050.2chr16:49475384-49475405GAACTGAAATTGAAAATAAAA-6.05
Enhancer Sequence
ATATTCAAAA TAGCTTTTTA AAAATATCGA CCTTGTCACA AGTTGTCCCC GTTCAAAAAT 60
GAACGAATGT GCGAATATAA AGCCAACTTT ACCTCAATGA TGGGTACAGT GTTGCTAACC 120
TGTAACACGG TTATTAGGAA AAGAGTGTGG AAAATAAAAA TATTACGGTA TTAAGTCAAA 180
TAGTTACTAA TGTCGCCTTA AGGAACAACG ACGACAAAAG ACCTAAACGC GTGAGGACAA 240
CGCCCAGATA ATAGCAGGTA ACGTTAGTAA TCGGCCCGAG CCCGGATGGC CTGCGGCGCC 300
CCCGGCTCCT ACCCCCGGCA TCGGCGAGTG TTATCAGCTA TGACTTGTAA CATTCAGTTT 360
GGGTGAAAAC GTAAACACAT AAAATGCAAA ACTAAAACAG AAATAAAGTG GAAATAAGCA 420
AAACATACCT TCTGAACTTC GAAGGAAAGG CGAGGATTGA CTGAAATTGT CAAAGAAATT 480
GAGAAAATGT CTTGACTTTC TCCAACCGTT CCACTGTTGT CATGGCACTG CATTCCAGAA 540
CAGAGATTCC CAATGACGCT GCGAGTGTTT TCATTCGGTT TAAAAACAAG CAGACATTTT 600
AAGTGACTAA ACGTGTAACG TACCTAAAGC ATACTGAATA ATGTTATTAA AACACACGCA 660
GTACTTAACA TCTGAAATGG ATCATGAAAA AGGTTCTCAA AATTAAGAAA AGAATGGGTG 720
TCGCAGAATA GTGCTGAACA CTGAACACAA ATTAATGATT AATAAATGAA CTGAAATTGA 780
AAATAAAATA ATACTACCAG ACAGGGTACC TTTCAGTTCC TTTCCAACTT GTGGCAGTAA 840
ACGCCAGTCA TTCATTTCTC TACGGTAGGC CTATTTCCTT TACCTCAGTC GGTCGGCGTC 900
TGGACGAGGG CAAATAACCC ATGTTCCCTT TACGCTCCCA GTTTGATGGA TCAACGATTT 960
GATTTATTGA GATACCCGAG ATATCTATAT CCATAGATAT TGATCTATAC CTATTGAGAT 1020
ATCTTTCAAG TGAACTGGGG CAGAATGTTG TTACACTCAC ATGACACCGT TTTCATTTAA 1080
AAAATATAGA AGTGCATACA AGTATATGCG TATATGTATA AATACAAGAT AGATAACGTA 1140
GATAGATAGC TAGATAGACA GATAGATAGC TAGATAGATA GATAGATATT TAACCTAACG 1200
TTAAGCTAGT CCATTAAGCA TCTTGAAATC TAGGCCTATA AACGTTACCC TATATTTTTA 1260
TTCATTCTTA TTTCTCTCGT TTTATTTATT TAAAAAAGAA GTAGTGACAG ATAATATACT 1320
GTAGATTGTG TACAAAGTGT TTTCAGCCAA GTTCTGATAA TGTTGATACA TTTAAGGAAG 1380
ATATGCGTAT ATTTTTATGC GTTTTAAATG TTTGTTAGGA TAGCTGCTAA CGTTAGCTAG 1440
TTAACGTCTG ACTAACCGCG TCATGACGCA AAATAGCATT TTAAATGATG AAAGATTCTC 1500
CATTAGTACG TTTATCCAGT TATTAGGGAT TTAAGAAGAC GTATTGTTAA CACCTTTTAT 1560
ATAAAATAAT ATTTTTTTAG ATCTTCAGTA GGCTAACGTT ACTGATGTCT TCAACCAAAA 1620
TCTCATGTTT ACCCGCCTCC CCTTTAACTT ACCTCAGATG GCGTGGACAT TATATTGTGT 1680
GTATGCAGAT TCATATGTTT ACTGCACACA TAACACAGCA CTTTGCGTTT TAAACTTCAT 1740
TTCATTAGCG TGTTTGTTTA CCTTGCAGTG CTCCTCATAT CCAGCAGATG GCAGCAGGGC 1800
GCTATCTCAG CAGTGCTTTA TGTGTTGTTT CTTCCCTTGT AAAACTTAAA CTTTACCTTA 1860
TTAAAGTGCT TGAAAAGTTT TCCAGTGTCT CTCCGGGTTT CTTCAGAGAG CTTTGCTGCC 1920
CTCCACTTAG ACTGATTTAG GCCAATTTGG TGTGCAGGTG ATGCAAAATT ACACAGAGGC 1980
AACTACGGTT TGTGTGAATC AAAATCAATA TGCCATGCAA AT 2022