EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10675 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:42878748-42879690 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA10MA0899.1chr16:42879420-42879431TTTTTATTACC-6.62
Sox3MA0514.1chr16:42879652-42879662CCTTTGTTTT+6.02
ZNF24MA1124.1chr16:42878911-42878924CATTCATTCATGC+6.71
ZNF384MA1125.1chr16:42879634-42879646AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr16:42879635-42879647AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr16:42879636-42879648AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr16:42879637-42879649AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr16:42879633-42879645TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr16:42879631-42879643TCTAAAAAAAAA+6.52
Enhancer Sequence
AGAGGGAGCT CGGCTCCTCT AAAAAAGGCA TGGGCTCTCC TGAAAACATG ATTTGTGAAA 60
TGTTATGGGG TCTCAAAAAT ACTGACAATG TGCTATTTTG ACGTGCAGTT TCAGTATTGT 120
GTAATGTGAT CATGGATTAT TATTTGTAAA AAAGTAAAAA TATCATTCAT TCATGCACGA 180
CTGCGATTTA CACCTCAAAG ATAAATGCAC ATGCTATTCT TGTCATGAGC ATCTAGGTGT 240
AGGGGCGCTG GAGCAAAGTC CAAGTCAAAG ACCTGACAGA TGCTTTCGTA GAGACACTGC 300
TTATTTTCTT TCTAAAACAA ATGATGTGAC GTTGTGTTTC ATTTTTTTTA GTTTATTCAA 360
TGTTCTTTTT TAAAAAGTAG GAGGAGCCAC TAGTGTTTTT GGGGGCACAC TTTAACATCA 420
CAAACTACTT AAACAATTAT TCAAAGTTTT TTGTTTAATG CATTTAATGC ATGTAAATTC 480
AAGACTGCAT TTCTTAATGT AAAGCTATGT ACACTCAATT TCTGATTTAT AAAAGCCGCT 540
GCATAGCCGA CGACTTCCTA TATTAAAAGT TTTAAAATCG CTATTGAAAA TAGAAGACTA 600
ATATATTCAA CAGTGGTGGA CATTTTGATA GTGTTTTACA ACATGAACAT GACTGTCACT 660
GAAGTTGTGT TTTTTTTATT ACCTGTGTCA ATTTGGGGCT GAAATTTTGA TGAATGCGGG 720
AAACTGCACG CAGTGCCGTA CCGTCACTAA CAAAAGTCAA GGAAAAGCAG CGAGAGGGAA 780
CGCGCACAAC ACAGAGAGTG TGCGAGAGAG GCCTCAGTCA TATCTCCGTC TACCACCAAT 840
GGCAGGCCTG TAGCCACCCC AGTGAAAGGG GTGATTCCTT ATTTCTAAAA AAAAAAAAAA 900
AGGACCTTTG TTTTTGCAAT AATACGCCTC ATTTTCTATT TA 942