EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10668 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:42592529-42593892 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr16:42593246-42593259ATTAAGTGGATTT-6.2
POU4F1MA0790.1chr16:42593025-42593039AATTAATTATGCAT-7.58
POU4F2MA0683.1chr16:42593023-42593039ACAATTAATTATGCAT-6.75
POU4F3MA0791.1chr16:42593023-42593039ACAATTAATTATGCAT-6.75
Enhancer Sequence
ATTTGGGAAA TATTTAAAAA AGAGGGGGAA AATTAAAAGG GGGGCTAACA CCTCTTTTAA 60
CTATTTAGTA CATGTTCATT TAGAGTCGGT TCAGACTGTC ATTTTTTAAG ACCGAACTTT 120
AAGCTAAAAA ATGGTTTAAT AGAAGATATT TTAGGAAATA TTTAAAAAAG AAAAAAATGT 180
CCGACTTGAA ATGTCTCAAC TGTACGTCCG CGACTAAATT GTTTTGTTAT CCTCCTCAGA 240
TAAAGTGTTC TGATGTTATT TATTTCAGGC TTAATGCGAC GACCTGGTGC ACATATCTAT 300
ATCCTAGTAT CTAAATTCTA AATTTGTTCG TTTTTTTCTC TCCACAATTT GAAATAAAAG 360
CATTTCTCCG TCCAGTCAAT ATAGACACTG AGGTGAGGGT GAGATGGAGA CAAAGTAGAC 420
CGTCATGCAC TTCGGTGGCA TCAGAAAACC TCTAATCAAA TGAAGATGGA TTTTGTGCGG 480
TTCATCGTAA CAACACAATT AATTATGCAT GACAGAGACA TTTATTGGGC TCATTTCACC 540
CGGACTCCAC TAAGTAACTG GGCAAATCGG GTTAAGGTCG CTGTTGTGCT GGTCGGACGG 600
CTGTTATCGG GACGGCAGAT CACCGGGCGG CCTCAGTCTG TCTGTCATTC ACGACTCCCG 660
CCTTTTCTCT CTGACAGACC AAACAAATGC ATCTGCTGAA AAAATTATTT GGCTTCAATT 720
AAGTGGATTT TTCCCGGAAT ACAAGTAAGG AATTATAATA ATAATAAAAT GTGATTGATA 780
CTATATCAAT AAGGGGAGGC TGGGTCTAGT TGTCACATGT GTCTGTCGTC TTGAAGATTG 840
TTTTTGAGGG ACTATTTTGT TTTAGCTAGC ATGATATTTG TAGGCTGTGT GGGTTTCAAA 900
TAAATGATAA AAAACATAAT GTCTAATATT TAAATTTCAT CATTTGTGTA GGCTAATAAA 960
ATCAAAGAAA TAAAAATTAA AGAAATCAAG TCAAGAATCA AGAATCACAC ACACACACAC 1020
ACACACACAC ACACACACAC ACACAAACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1080
ACACACACAC ACACACACCA TGAAGATATA GCCTAGTTAA ACGGCAACAG AAACAAGTTT 1140
GTATGCAAAA TAGGCCTATT GCGATACATT TCGGTAATTC CTTTATTTGA AATTTAATAG 1200
CCTACTTATG GATGTATTTA CATTAATAAT TATGTTAAGT ATATATCATT CATTTTCTTG 1260
TCGGCTTAGT CCCTTTATTA ATCCGGGGTC GCCACAGCGG AATGAACCGC CAACTTATCC 1320
AGCAAGTTTT TACGCAGCGG ATGCCCTTCC AGCCACAACC CAT 1363