EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10601 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:40395683-40397226 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr16:40396059-40396078TGTTGCCACCTGCTGGCGA-7.01
EHFMA0598.2chr16:40396454-40396466AACCCGGAAGTC+6.14
ELF1MA0473.2chr16:40396454-40396466AACCCGGAAGTC+6.74
ELF2MA1483.1chr16:40396454-40396466AACCCGGAAGTC+6.52
ELF4MA0641.1chr16:40396454-40396466AACCCGGAAGTC+6.18
LHX2MA0700.1chr16:40396881-40396891GTTAATTAGT-6.02
RFX1MA0509.2chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG-7.52
RFX1MA0509.2chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG+7.53
RFX2MA0600.2chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG+7.63
RFX2MA0600.2chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG-7.66
RFX3MA0798.1chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG+7.64
RFX3MA0798.1chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG-7.81
RFX4MA0799.1chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG-7.36
RFX4MA0799.1chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG+7.74
RFX5MA0510.2chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG-7.37
RFX5MA0510.2chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG+7.41
Enhancer Sequence
TTTTTTTCAC TTGTTAGATC GTTCACGGAG GACTTTCAAT AATACGTCTC ACGAACAACT 60
AAGCAAAATG AATTTATCAG ATGTCACTTT ATCATGGTAA GCACGAAGCA TGCGTATCTG 120
ATGTTTCTCA ACTGGTAACC CGCGAGTTAG CAAAAATAAA ACATTTGGAG CTTATTGCAG 180
AACAATTTTT GACCATTAAA TACTTCAAAG TCTTATATGT GTTAATGCTT TCATGTCTGC 240
ACTGAAACAA TGTGGAATTT TACTTATCTC GTCAGCTTAA AGGTTTACGT TTTTGTCTGG 300
AGTGGACCTG AAAGCTCGTC GAGCGAGCTT TTGACGTACG TTAGCACAGT TCACGCGCAT 360
TTTTAATGTG ATCATTTGTT GCCACCTGCT GGCGAGAATT TGTCAGTGAA TCTTATTTTC 420
TCAGTTTAGT CAGTGTGAAA AAATATCCCA GTCGATTGCA TTTTCTTTTG TGTCATTGTT 480
TTAAATGAAC AAAACGTGCG TTTTCATAAC TTAACGTTAA GTTAACGTTA GACGTTATAA 540
AAATCAGAAG TTATAAGAGA AAATGCGCCT GAATTGCAAT CTATATGCCT CGGTCGCCTT 600
ATCCTCAGAC GCTATGTTGG TGTTTAAAAA CTGTAGACGG TCTGTGTAAA TCATCAGTTG 660
TCGTGGCCGA GTGGTTAAGG CGATGGACTA GAAATCCATT GGGGTCTCCC CGCGCAGGTT 720
CGAATCCTGC CGACAACGAA TCGTTTTCCT TCTAGAACTT ACACCCACAA CAACCCGGAA 780
GTCTCGTGTC CTTTGAGAGA ACACGATTAT GTGTTTACCG GGACACTATT TTGAATTCTG 840
ATCGAGTATG TCATTAATTT TATGATGCCT TTCTGAACCG ATAACAAAAA TAAAATCCAC 900
ACGTTTCCAT GGTAACGGAC GTGGCGTTCT CCATCGGACA ATCATGGCGG ATGATTTGGA 960
CGATTTACTT GATGAAGTCG AATCAAAGTT TTGTTGCAAC ACTTCGGAGT CTAAACAGAC 1020
AAGCCGTGTT ATGAAACATA CGGATCAAAA GTGTGACAAT CTCGAAGAAA GGAAACTGCC 1080
AAGGTAGTAG GCTAGCAAGA TTAGCAACCA GAGCTAACGT GGCTAATTAT GTCAGACTAA 1140
CGTTAGTGCA ATAAAGAAGC ACGTTTGATA CAATGTAAAC GCAGCTTTAA GGCTCAGTGT 1200
TAATTAGTAT TAGTGTAACT AAGATGCCAA ATTATGTTAT TACCTCAAAT ATAAGAATTA 1260
GACAGTGCAT AGTGGCTAAC ATCTGATAAC ACGAGCCTGA TTCATACATC TTTAATGCTG 1320
GTCCCTAGGG AAGATCAAGA CACAATATTA ACATATCGAA TTTTATTTCC ACTGTTACCA 1380
GAAAACAAGG ACGTAAAAGA GTTGAAAATG AGATAGATAT TGACGCTATG CTGCATGAAA 1440
TACTGGATGA TGATGTTGAT ACACCAACCA GCACACATGT AAGCCAAATG ACCAGACAAA 1500
ACCTTGTCAT TAATACTGAA TAAAATACTT TTCAAATAAC ATT 1543