EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10525 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:36625375-36627228 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr16:36626778-36626791ATTAAGTGTTTTT-6.42
PBX1MA0070.1chr16:36625515-36625527ACATCAATCAAA+6.74
RFX1MA0509.2chr16:36626186-36626202AGTTGTCATGGAAACG+6.52
RFX1MA0509.2chr16:36626186-36626202AGTTGTCATGGAAACG-6.54
RFX2MA0600.2chr16:36626186-36626202AGTTGTCATGGAAACG+6.39
RFX2MA0600.2chr16:36626186-36626202AGTTGTCATGGAAACG-6.5
RFX3MA0798.1chr16:36626186-36626202AGTTGTCATGGAAACG-6.16
RFX3MA0798.1chr16:36626186-36626202AGTTGTCATGGAAACG+6.26
RFX4MA0799.1chr16:36626186-36626202AGTTGTCATGGAAACG+6.18
RFX4MA0799.1chr16:36626186-36626202AGTTGTCATGGAAACG-6.51
RFX5MA0510.2chr16:36626186-36626202AGTTGTCATGGAAACG-6.01
RUNX3MA0684.1chr16:36626290-36626300AAACCGCAAA+6.02
Enhancer Sequence
TTTTTTTAAT TCAAAAGCCT TTTCCCAAAA TATGTCAAAA TAGTTTGTCA CTAAAAAAAT 60
CACTCCATTT GCTGAAACTG AGAGAAAGTT GAGGCCAAAT GACCCCAGTG TGTATGAAAC 120
AGCAACACAA GGGTTAAACA ACATCAATCA AACATTAAAA ATACATTCAA ATCTACCAGA 180
ACCAGGAGAA GGCCCTATCC TCTGTCTACA TGGCGGCCTT CTTTGTCCGG AAGGACCGGG 240
AACATGAAAC ATACTTTTTT CCATTTATTA GCAGTAAATA ACGCTCTCTA GGGTGTATAA 300
ATGAGTTTAC TGCAGTTAAT TATCTGAGTT TTCGCCTTGT CTGAGTATCA AATGAAGAGT 360
TCCTCAATAC ACGTCTGTTC TGTCAGGCGT CTGGTGGATT CTGACACTCG CGGTGCAGAA 420
CGCGTTCGAT TTATGACGTA GCGTAGGGCC AGACCAAAGA TGGGATGGGG GTCATGTAGG 480
TACAGGTGTT CGCGTTTATT CTTCAGGGTG TAAAAGGTGA AGTGGCATAT TAACCTACTG 540
TTTAGGGCTC GTGATAACAT TATAAAATAC GCGTGGACCT TATACAACTC TTTTGCCATC 600
TCTGCATGGG GAAAAGAGGG AAGAATAAAG TTAATCACGC AAGGCCTGGC ATGATTGATA 660
TTTGACTGGT CCAACACGGC TGATTAATTT GAGGACTCTG TATCGGCCTT TAGCTCTGCA 720
CTGAATTTAC AATGTAATAC GGAATCACGA TGCTTTGACT CTTGTCCAGA AGTCTGCTGC 780
TAAGAAATCG AAAGCTCCGG AGTCTAATGT TAGTTGTCAT GGAAACGAGG ATGTCTTGGC 840
GGCAGTACGT GAAGTTGCTA ACCTATGGAA TAAAATTTCT GTTATAATTA TAAAATTCAC 900
GCATCTGCAA TTATGAAACC GCAAAGGAAA ACGAAACATA ACTTGTAACG TTACTTTACA 960
GACACAAAAT AGTTTCACCA CGGACACGAA GAGTACGAAT CAAACAGCGA CAGTCCACTG 1020
TCAAAATACA TCACCGCGGT CACAGGCATT AATTAACGAG CCAGAGTCAT CGATCACACC 1080
AGTGCGCTTG CGTGATGAGA TCCTGAATCC TGACTGAAGG AAGCCCGCCG AACAAAATGT 1140
CTGGGCAGCT CCCACACACC GTCTCAGGTA AGACTTTTGT TAATCCCTCT TTGAGAAATG 1200
TCCTCCATGA GCTGTAATAA AGGTTGAGAC TCAATGAGGT CCATTTTCGC TGTGTTTCTT 1260
AGACATTTTA CAGAATCAAA ATTAAGATCG GGCCGAGGAT AGCAAGCTAA GTTAGCATAA 1320
CGTAAGTGAA CTTGACAGGC AGCGAGCGCA GAACTTCTCA GTGAATCTCT TAACGGTGTT 1380
TAACTATAAC ATGGCATCTG TTGATTAAGT GTTTTTGAAA GCCAGATAGA TTATTGATCT 1440
ATTATAAAGA AGATATCAGC AAAAGGCAAG TTAAATATTT GAGGGTTTTT GCTTATTTTT 1500
ATGACACTGA ATCAAATCCT TCAATTGTTT AAAAAACTTG AGATCTACGT TAATTTATCT 1560
TATTATCACC GAATGAGTGG GAAAATATAT TGAATAATGT AATAAAGTCT GTGCAGATTA 1620
GCAATTGGTT AAATAAGTGA CCCGGACCCA TGGGCGTAAA TCATGAGGGG CAGTCATTTA 1680
AACACTCGTA TTTCATCTGA AAGCTGAATA ATTAAGCTCC TCATTGATTT ATGAGAGAAG 1740
ATTATATGTT CAGATATACG TTTTTATATT ATCTTTAAGT TAGCAATCCA CATTACTAAG 1800
CAGAAATGAC GTTTTTATAT ATTTATAGCA ATTTACAAAG TCTTTATAAA GAG 1853