EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10512 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:36559681-36562149 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr16:36561934-36561947ATTAAGTGTTTTT-6.42
PBX1MA0070.1chr16:36560671-36560683ACATCAATCAAA+6.74
RFX1MA0509.2chr16:36561342-36561358AGTTGTCATGGAAACG+6.52
RFX1MA0509.2chr16:36561342-36561358AGTTGTCATGGAAACG-6.54
RFX2MA0600.2chr16:36561342-36561358AGTTGTCATGGAAACG+6.39
RFX2MA0600.2chr16:36561342-36561358AGTTGTCATGGAAACG-6.5
RFX3MA0798.1chr16:36561342-36561358AGTTGTCATGGAAACG-6.16
RFX3MA0798.1chr16:36561342-36561358AGTTGTCATGGAAACG+6.26
RFX4MA0799.1chr16:36561342-36561358AGTTGTCATGGAAACG+6.18
RFX4MA0799.1chr16:36561342-36561358AGTTGTCATGGAAACG-6.51
RFX5MA0510.2chr16:36561342-36561358AGTTGTCATGGAAACG-6.01
ZNF384MA1125.1chr16:36560529-36560541TTTTTTTTTAAT-6.74
Enhancer Sequence
AGAGGACTTT ACTGTACAGA GTTAACGAAC AAAAGACAAA CAGTCTCTGA ATTCCCAAAG 60
TCGTAGCCCA GATTAACATG AGAAAAGCAT CATGTTTGAA AATAAATGGC TTAATAAGGG 120
TTCAACATGT TGCAGAATAA AATAATCTTA AAAGACACTC TAAAAGTGTA AATAATAATT 180
ATTCATTATT GTGCATGTTC ATTATTATGA TATACTGAAT TATTGAATAT TGGCATGTGA 240
CTACTTTTTT CTGTTATATG TATATAAAGT CACTGTTAAA CGGCAGAGTT AAATTTTCTG 300
CATCAAAACT CGGCAGAGCA CATATTAATT CCCATCATAG CCATAAATAA ACAGAAAACA 360
GCAGTGAATC ACAAAATGAT CAGTAGATAT TTGTATAACC ACAGCCGCAG ACAGACTCAT 420
CTATTAAATG TATTTTGTGA TGCTTCAAAT ATGAATCACG CATGATGTTT TCAGACTTAC 480
CACATTGCTG TCAACTTCTG AAAAAGTCGA CTTGATGATA AACTGTGGAT GAAAAGTAGA 540
ATTAAACATG AGTGAGCAAT CAAACATGAT TTCTCCAAAG TTGATGTCCT CTAAACTGGA 600
CTAGGGTGAA TAGACTTACC TGTTTGCCGT CCACTTTTCT GATACCACGA TAGACATTGC 660
CGTAGCAGCC AGCTCCAATA TTTTCTTTCA GGTCATATTT TACTTCCACT GAAAGATGAA 720
AACAGCATGT TCATTTGAGA CAGCTTCCAG TTATGCCTGA ACAGACAGTA TAAAAATAAA 780
GCAATTTAAC CCGTAACAGC CAACAACATA AACAAAGCCA ATTTGCCCCG AATTAAGTTT 840
TTTGAAACTT TTTTTTTAAT TCAAAAGCCT TTTCCCAAAA TATGTCAAAA TAGTTTGTCA 900
CTAAAAAAAT CACTCCATTT GCTGAAACTG AGAGAAAGTT GAGGCCAAAT GACCCCAGTG 960
TGTATGAAAC AGCAACACAA GGGTTAAACA ACATCAATCA AACATTAAAA ATACATTCAA 1020
ATCTACCAGA ACCAGGAGAA GGCCCTATCC TCTGTCTACA TGGCGGCCTT CTTTGTCCGG 1080
AAGGACCGGG AACATGAAAC ATACTTTATT CCATTTATTA GCAGTAAATA ACGCTCTCTA 1140
GGGCGTATAA ATGAGTTTAC TGCAGTTAAT TATCTGAGTT TTCGCCTTGT CTGAGTATCA 1200
AATGAAGAGT TCCTCAATAC ACGTCTGTTC TGTCAGGCGT CTGGTGGATT CTGACACTCG 1260
CGGTGCAGAA CGCGTTCGAT TTATGACGTA GCGTAGGGCC AGACCAAAGA TGGGATGGGG 1320
GTCCTGTAGG TACAGGTGTT CGCGTTTATT CTTCAGGGTG TAAAAGGTGA AGTGGCATAT 1380
TAACCTACTG TTTAGGGCTC GTGATAACAT TATAAAATAC GCGTGGACCT TATACAACTC 1440
TTTTGCCATC TCTGCATGGG GAAAAGAGGG AAGAATAAAG TTAATCACGC AAGGCCTGGC 1500
ATGATTGATA TTTGACTGGT CCAACACGGC TGATTAATTT GAGGACTCTG CATCGGCCTT 1560
TAGCTCTGCA CTGAATTTAC AATGTAATAC GGAATCACGA TGCTTTGGCT TTTGTCCAGA 1620
AGTCTGCTGC TAGGAAATCG AAAGCTCCGG AGTCTAATGT TAGTTGTCAT GGAAACGAGG 1680
ATGTCTTGGC GGCAGTACGT GAAGTTGCTA ACCTATGGAA TAAAATTTCT GTTATAATTA 1740
TAAAATTCAC GCATCTGCAA TTATGAAACA GCAAAGGAAA ACGAAACATA ACTTGTAACG 1800
TTACTTTACA GACACAAAAT AGTTTCACCA CGGACACGAA GAGTACGAAT CAAACAGCGA 1860
CAGTCCACTG TCAAAATACA TCACCGCGGT CACAGGCATT AATAAACGAG CCAGAGTCAT 1920
CGAACACACC AGTGCGCTTG CGTGATGAGA TCCTGAATCC TGACTGAAGG AAGCCCGCCG 1980
AACAAAATGT CTGGGCAGCT CCAACACACC GTCTCAGGTA AGACTTTTGT TAATCCCTCT 2040
TTGAGAAATG TCCTCCATGA GCTGTAATAA AGGTTGAGAC TTAATGAGGT CCATTTTCGC 2100
TGTGTTTCTT AGACATTTTA CAGAATCAAA ATTAAGATCG GGCCGAGGAT AGCAAGCTAA 2160
GTTAGCATAA CGTAAGTGAA CTTGACAGGC AGCGAGCGCA GAACTTCTCA GTGAATCACT 2220
TAACGGTGTT TAACTATAAC ATGGCATCTG TTGATTAAGT GTTTTTGAAA GCCAGATAGA 2280
TTATTGATCT ATTATAAAGA AGATATCAGC AAAAGGCAAG TTAAATATTT GAGGGTTTTT 2340
GCTTATTTTT ATGACACTGA ATCAAATCCA TCAATTGTTT AAAAAACTTG AGATCTACGT 2400
TAATTAATCT TATTATCACC GAATGAGTGG GAAAATATAT TGAATAATGT AATAGAGTCT 2460
GTGCAGAT 2468