EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10479 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:36423958-36426320 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr16:36425812-36425825ATTAAGTGTTTTT-6.42
PBX1MA0070.1chr16:36424549-36424561ACATCAATCAAA+6.74
RFX1MA0509.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG+6.52
RFX1MA0509.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.54
RFX2MA0600.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG+6.39
RFX2MA0600.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.5
RFX3MA0798.1chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.16
RFX3MA0798.1chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG+6.26
RFX4MA0799.1chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG+6.18
RFX4MA0799.1chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.51
RFX5MA0510.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.01
RUNX3MA0684.1chr16:36425324-36425334AAACCGCAAA+6.02
Enhancer Sequence
ACCACAGCCG CAGACAGACT CATCTATTAA ATGTATTTTG TGATGCTTCA AATATGAATC 60
ACGCATGATG TTTTCAGACT TACCACATTG CTGTCAACTT CTGAAGTAGT CGACTTGATG 120
ATAAACTGTG GATGAAAAGT AGAATTAAAC ATGAGTGAGC AATCAAACAT GATTTCTCTA 180
AAGTTGATGT CCTCTAAACT GGACTAGGGT GAACAGACTT ACCTGTTTGC CGTCCATTTT 240
TCTGATACCA CGATAGACAT TGCCGTAGCA GCCAGCTCCA ATATTTTCTT TCAGGTCATA 300
TTTTGCTTCC ACTGAAAGAT AAAAACAGCA TGTTCATTTG AGACAGCTTC TAGTTATGCC 360
TGAACAGACA GTATAAAAAT AAAGCCATTT AACCCGTAAC AGCCAACAAC ATAAACAAAG 420
CCAATTTGCC CCGAATTAAG TTTTTTGAAA CTTTTTTTAA TTCAAAAGCC TTTTCCCAAA 480
ATATGTCAAA ATAGTTTGTC ACTAAAAAAA TCACTCCATT TGCTGAAACT GAGAGAAAGT 540
TGAGGCCAAA TGACCCCAGT GTGTATGAAA CAGCAACACA AGGGTTAAAC AACATCAATC 600
AAACATTAAA AATACATTCA AATGTACCAG AACCAGGAGA AGGCCCTATC CTCTGTCTAC 660
ATGGCGGTCT TCTTTGTCCG GAAGGACCGG GAACATGTAA CATACTTTTT TCCATTTATT 720
AGCAGTAAAT AACGCTCTCT AGGGTGTATA AATGAGTTTA CTGCAGTTAA TTATCTGAGT 780
TTTCGCCTTG TCTGAGTATC AAATGAAAAG TTCCTCAATA CACGTCTGTT CTGTCAGGCG 840
TCTGGTGGAT TCTGACACTC GCGGTGCAGA GCGCGTTCGA TTTATGACGT AGCGTAGGGC 900
CAGACCAAAG ATGGGATGGG GGTCCTGTAG GTACAGGTGT TCGCGTTTAT TCTTCAGGGT 960
GTAAAAGGTG AAGTGGCATA TTAACCTACT GTTTAGGGCT CGTGATAACA TTATAAAATA 1020
CGCGTGGACC TTATACAACT CTTTTGCCAT CTCTGCATGG GGAAAAGAGG GAAGAATAAA 1080
GTTAATCACG CAAGGCCTGG CATGATTGAT GTTTGACGGG TCCAACACGG CTGATTAATT 1140
TGAGGACTCT GCATCGGCCT TTAGCTCTGC ACTGAATTTA CAATGTAATA CGGAATCACG 1200
ATGCGTTGAC TCTTGTCCAG AAGTCTGCTG CTAAGAAATC GAGAGCTCCG GAGTCTAATG 1260
TTAGTTGTCA TGGAAACGAG GATGTCTTGG CGGCAGTACG TGAAGTTGCT AACCTATGGA 1320
ATAAAATTTC TGTTATAATT ATAAAATTCA CGCATCTGCA ATTATGAAAC CGCAAAGGAA 1380
AACGGAACAT AACTTGTGAC GTTACTTTAC AGACACGAAA TAGTTTCACC ACGGACACGA 1440
AGAGTACGAA TCAAACAGCG ACAGTCCACT GTCAAAATAC ATCACCGCGG TCACAGGCAT 1500
TAATAAACGA GCCAGAGTCA TCGATCACAA CAGTGCGCTT GCGTGATGAG ATCCTGAATC 1560
CTGACTGAAG GAAGCCCCCC GAACAAAATG TCTGGGCAGC TCCCACACAC CGTCTCAGGT 1620
AAGACTTTTG TTAATCCCTC TTTGAGAACT GTCCTCCATG AGCTGTAATA AAGGTTGAGA 1680
CTCAATGAGG TCCATTTTCG CTGTGTTTCT TAGACATTTT ACAGAATCAA AATTAAGATC 1740
GGGCCGAGGA TAGCAAGCTA AGTTAGCATA ACGTAAGTGA ACTTGACAGG CAGCGAGCGC 1800
AGAACTTCTC AGTGAATCAC TTAACGGTGT TTAACTATAA CATGGCATCT GTTGATTAAG 1860
TGTTTTTGAA AGCCAGATAG ACTATTGATC TATTATAAAG AAGATATCAG CAAAAGGCAA 1920
GTTAAATATT TGAGGGTTTT TGCTTATTTT TATGACACTG AATCAAATCC ATCAATTGTT 1980
TAAAAAACTT GAGATCTACG TTAATTTATC TTATTATCAC CGAATGAGTG GGAAAATATA 2040
TTGAATAATG TAATAAAGTC TGTGCAGATT AGCAATTGGT TAAATAAGTG ACCCGGACCC 2100
ATGGGCGTAA ATCATGAGGG GCAGTCATTT AAACACTCGT ATTTCATCTG AAAGCTGAAT 2160
AAATAAGCTC CTCATTGATT TATGAGAGAA GATTATATGT TCAGATATAC GTTTTTATAT 2220
TATCTTTAAG TTAGCAATCC ACATTACTAA GCAGAAATGA CGTTTTTATA TATTTATAGC 2280
AATTTACAAA GTCTTTATGA AGAGAATTCT TATCTAAAGT AGAGTAACCT AACTTAAATA 2340
ATTTGAGCAA ATAGCCAAAA AA 2362