EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10448 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:36343271-36345028 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PBX1MA0070.1chr16:36343978-36343990ACATCAATCAAA+6.74
RFX1MA0509.2chr16:36344649-36344665AGTTGTCATGGAAACG+6.52
RFX1MA0509.2chr16:36344649-36344665AGTTGTCATGGAAACG-6.54
RFX2MA0600.2chr16:36344649-36344665AGTTGTCATGGAAACG+6.39
RFX2MA0600.2chr16:36344649-36344665AGTTGTCATGGAAACG-6.5
RFX3MA0798.1chr16:36344649-36344665AGTTGTCATGGAAACG-6.16
RFX3MA0798.1chr16:36344649-36344665AGTTGTCATGGAAACG+6.26
RFX4MA0799.1chr16:36344649-36344665AGTTGTCATGGAAACG+6.18
RFX4MA0799.1chr16:36344649-36344665AGTTGTCATGGAAACG-6.51
RFX5MA0510.2chr16:36344649-36344665AGTTGTCATGGAAACG-6.01
RUNX3MA0684.1chr16:36344753-36344763AAACCGCAAA+6.02
Enhancer Sequence
TGCAGAGTTA AATTTTCAGC ATCAAAACTC GGCAGAGCAC ATATTAATTC CCATCATAAC 60
CATAAATAAA CAGAAAACAG CAGTGAATCA CAAAATGATC AGTAGATATT TGTATAACCA 120
CAGCCGCAGA CAGACTCATC TAATAAATGT ATTTTGTGAT GCTTCAAATA TGAATCACGC 180
ATGATGTTTT CAGACTTACC ACATTGCTGT CAACTTCTGA AGTAGTCGAC TTGATGATAA 240
ACTGTGGATG AAAAGTAGAA TTAAACATGA GTGAGCAATC AAACATGATT TCTCTAAAGT 300
TGATGTCCTC TAAACTGGAC TAGGGTGAAT AGACTTACCT GTTTGCCGTC CACTTTTCTG 360
ATACCACGAT AGACATTGCC GTAGCAGCCA GCTCCAATAT TTTCTTTCAG GTCATATTTT 420
GCTTCCACTG AAAGATAAAA ACAGCATGTT CATTTGAGAC AGCTTCTAGT TATGCCTGAA 480
CAGACAGTAT AAAAATAAAG CAATTTAACC CGTAACAGCC AACAACATAA ACAAAGCCAA 540
TTTGCCCCGA ATTAAGTTTT TTGAAACTTT TTTTAATTCA AAAGCCTTTT CCCAAAATAT 600
GTCAAAATAG TTTGTCACTA AAAAAATCAC TCCATTTGCT GAAACTGAGA GAAAGTTGAG 660
GCCAAATGAC CCCAGTGTGT ATGAAACAGC AACACAAGGG TTAAACAACA TCAATCAAAC 720
ATTAAAAATA CATTTAAATG TACCAGAACC AGGAGAAGGC CCTATCCTCT GTCTACATGG 780
CGGTCTTCTT TGTCCGGAAG GACCGGGAAC ATGTAACATA CTTTTTTCCA TTTATTAGCA 840
GTAAATAACG CTCTCTAGGG TGTATAAATG AGTTTACTGC AGTTAATTAT CTGAGTTTTC 900
GCCTTGTCTG AGTATCAAAT GAAAAGTTCC TCAATACACG TCTATTCTGT CAGGCGTCTG 960
GTGGATTCTG ACACTCGCGG TGCAGAGCGC GTTCGATTTA TGACGTAGCG TAGGGCCAGA 1020
CCAAAGATGG GATGGGGGTC CTGTAGGTAC AGGTGTTCGC GTTTATTCTT CAGGGTGTAA 1080
AAGGTGAAGT GGCATATTAA CGTACTGTTT AGGGCTCGTG ATAACATTAT AAAATACGCG 1140
TGGACCTTAT AAAACTCTTT TGCCATCTCT GCATGGGGAA AAGAGGGAAG AATAAAGTTA 1200
ATCACGCAAG GCCTGGCATG ATTGATATTT GACGGGTCCA ACACGGCTGA TTAATTTGAG 1260
GACTCTGCAT CGGCCTTTAG CTCTGCACTG AATTTACAAT GTTATACGGA ATCACGATGC 1320
TTTGACTCTT GTCCAGAAGT CTGCTGCTAA GAAATCGAGA GCTCCGGAGT CTAATGTTAG 1380
TTGTCATGGA AACGAGGATG TCTTGGCGGC AGTACGTGAA GTTGCTAACC TATGGAATAA 1440
AATTTCTGTT ATAATTATAA AATTCACGCA TCTGCAATTA TGAAACCGCA AAGGAAAACG 1500
GAACATAACT TGTGACGTTA CTTTACAGAC ACGAAATAGT TTCACCACGG ACACGAAGAG 1560
TACGAATCAA ACAGCGACAG TCCACTGTCA AAATACATCA CCGCGGTCAC AGGCATTAAT 1620
AAACGAGCCA GAGTCATCGA TCACAACAGT GCGCTTGCGT GATGAGATCC TGAATCCTGA 1680
CTGAAGGAAG CCCGCCGAAC AAAATGTCTG GGCAGCTCCC ACACACCGTC TCAGGTAAGA 1740
CTTTTGTTAA TCCCTCT 1757