EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10419 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:36272024-36276636 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr16:36274986-36275003ATCCATTAATTAATGAA+7.41
ArxMA0874.1chr16:36274987-36275004TCCATTAATTAATGAAA-7.6
Nkx3-2MA0122.3chr16:36274049-36274062ATTAAGTGTTTTT-6.42
PBX1MA0070.1chr16:36272786-36272798ACATCAATCAAA+6.74
POU6F1MA0628.1chr16:36274990-36275000ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr16:36274990-36275000ATTAATTAAT-6.02
RFX1MA0509.2chr16:36273457-36273473AGTTGTCATGGAAACA+6.21
RFX1MA0509.2chr16:36273457-36273473AGTTGTCATGGAAACA-6.23
RFX2MA0600.2chr16:36273457-36273473AGTTGTCATGGAAACA+6.11
RFX2MA0600.2chr16:36273457-36273473AGTTGTCATGGAAACA-6.18
RFX4MA0799.1chr16:36273457-36273473AGTTGTCATGGAAACA-6.23
RUNX3MA0684.1chr16:36273561-36273571AAACCGCAAA+6.02
SPI1MA0080.4chr16:36275094-36275108GAAAAGCGGAAGAA+6.01
SPICMA0687.1chr16:36275094-36275108GAAAAGCGGAAGAA+6.2
Enhancer Sequence
AATATTGGCA TGTGACTACT TTTTCTGTTA TATGTATATA AAGTCACTGT TAAACTGCAG 60
AGTTAAATTT TCAGCATCAA AACTCGGCAG AGCACATATT AATTCCCATC ATAACCATAA 120
ATAAACAGAA AACAGCAGTG AATCACAAAA TGATCAGTAG ATATTTGTAT AACCACAGCC 180
GCAGACAGAC TCATCTATTA AATGTATTTT GTGATGCTTC AAATATGAAT CACGCATGAT 240
GTTTTCAGAC TTACCACATT GCTGTCAACT TCTGAAGTAG TCGACTTGAT GATAAACTGT 300
GGATGAAAAG TAGAATTAAA CATGAGTGAG CAATCAAACA TGATTTCTCT AAAGTTGATG 360
TCCTCTAAAC TGGACTAGGG TGAATAGACT TACCTGTTTG CCGTCCACTT TTCTGATACC 420
ACGATAGACA TTGCCGTAGC AGCCAGCTCC AATATTTTCT TTCAGGTCAT ATTTTGCTTC 480
CACTGAAAGA TAAAAACAGC ATGTTCATTT GAGACAGCTT CTAGTTATGC CTGAACAGAC 540
AGTATAAAAA TAAAGCCATT TAACCCGTAA CAGCCAACAA CATAAACAAA GCCAATTTGC 600
CCCGAATTAA GTTTTTTGAA ACTTTTTTTA ATTCAAAAGC CTTTTCCCAA AATATGTCAA 660
AATAGTTTGT CACTAAAAAA ATCACTCCAT TTGCTGAAAC TGAGAGAAAG TTGAGGCCAA 720
ATGACCCCAG TGTGTATGAA ACAGCAACAC AAGGGTTAAA CAACATCAAT CAAACATTAA 780
AAATACATTC AAATGTACCA GAACCAGGAG AAGGCCCTAT CCTCTGTCTA CATGGCGGTC 840
TTCTTTGTCC GGAAGGACCG GGAACATGTA ACATACTTTT TTCCATTTAT TAGCAGTAAA 900
TAACGCTCTC TAGGGTGTAT AAATGAGTTT ACTGCAGTTA ATTATCTGAG ATTTCGCCTT 960
GTCTGAGTAT CAAATTAAGA GTTCCTCAAT ACACGTCTGT TCTGTCAGGC GTCTGGTGGA 1020
TTCTGACACT CGCGGTGCAG AGCGCGTTCG ATTTATGACG TAGCGTAGGG CCAGACCAAA 1080
GATGGGATGG GGGTCCTGTA GGTACAGGTG TTCGCGTTTA TTCTTCAGGG TGTAAAAGGT 1140
GAAGTGGCAT ATTAACCTAC TGTTTAGGGC TCGTGATAAC ATTATAAAAT ACGCGTGGAC 1200
CTTATACAAC TCTTTTGCCA TCTCTGCATG GGGAAAAGAG GGAAGAATAA AGTTAATCAC 1260
GCAAGGCCTG GCATGATTGA TATTTGACGG GTCCAACACG GCTGATTAAT TTGAGGACTC 1320
TGCATCGGCC TTTAGCTCTG CACTGAATTT ACAATGTAAT ACGGAATCAC GATGCTTTGA 1380
CTCTTGTCCA GAAGTCTGCT GCTAAGAAAT CGAGAGCTCC GGAGTCTAAT GTTAGTTGTC 1440
ATGGAAACAA GGATGTCTTG GCGGCAGTAC GTGAAGTTGC TAACCTATGG AATAAAATTT 1500
CTGTTATAAT TATAAAATTC ACGCATCTGC AATTATGAAA CCGCAAAGGA AAACTGAACA 1560
TAACTTGTGA CGTTACTTTA CAGACACGAA ATAGTTTCAC CACGGACACG AAGAGTACGA 1620
ATCAAACAGC GACAGTCCAC TGTCAAAATA CATCACCGCG GTCACAGGCA TTAATAAACG 1680
AGCCAGAGTC ATCGATCACA ACAGTGCGCT TGCGTGATGA GATCCTGAAT CCTGACTGAA 1740
GGAAACCCGC CGAACAAAAT GTCTGGGCAG CTCCCACACA CCGTCTCAGG TAAGACTTTT 1800
GTTAATCCCT CTTTGAGAAC CGTCCTCCAT GAGCTGTAAT AAAGGTTGAG ACTCAATGAG 1860
GTCCATTTTC GCTGTGTTTC TTAGACATTT TACAGAATCA AAACTAAGAT CGGGCCGAGG 1920
ATAGCAAGCT AAGTTAGCAT AACGTAAGTG AACTTGACAG GCAGCGAGCG CAGAACTTCT 1980
CAGTGAATCA CTTAACGGTG TTTAACTATA ACATGGCATC TGTTGATTAA GTGTTTTTGA 2040
AAGCCAGATA GACTATTGAT CTATTATAAA GAAGATATCA GCAAAAGGCA AGTTAAATAT 2100
TTGAGGGTTT TTGCTTATTT TTATGACACT GAATCAAATC CATCAATTGT TTAAAAAACT 2160
TGAGATCTAC GTTAATTTAT CTTATTATCA CCGAATGAGT GGGAAAATAT ATTGAATAAT 2220
GTAATAAAGT CTGTGCAGAT TAGCAATTGG TTAAATAAGT GACCCGGACC CATGGGCGTA 2280
AATCATGAGG GGCAGTCATT TAAACACTCG TATTTCATCT GAAAGCTGAA TAATTAAGCT 2340
CCTCATTGAT TTATGAGAGA AGATTATATG TTCAGATATA CGTTTTTATA TTATCTTTAA 2400
GTTAGCAATC CACATTACTA AGCAGAAATG ACGTTTTTAT ATATTTATAG CAATTTACAA 2460
AATCTTTATG AAGAGAATTC TTATCTAAAG TAGAGTAACC TAACTTAAAT AATTTGAGCA 2520
AATAGCCAAA AAAGTATATT TTGTCTCATA TAGTGACTAT TCCCTCAAAT CTACCTGCTC 2580
AACATAAGAC TCGTTTCTTA GTATTAGAAA AATGCCCAAT ATCTATCTGT CTGTCTGTTT 2640
TTAATTAGCT CAGATTATGT CCTGCTTACA AGCACTTGAA TCTATGAAAA CTGATCATAC 2700
TAAGATTTTT AGCATAATAG AAAAAGTGGA CCTTTTAAAG ACTAAAGACT TTGATATTAT 2760
TTTCTGCTGG ATACCAGGCT GGTCATATGG GATGAGTTGG AAATGAGCGT GCAGATAAAG 2820
CATGATAAAG GAAGATAGAA GTTGGAGATA ACAGAACGTA AACTTCCTGT GTCTGATGTT 2880
AAAACTGTTT TAAATCTGTA TGTTAATGAG AAATGGCAGA TGGAATGGGA TGAATGTAGG 2940
AAAAACACAT GGTATGAAGT GAATCCATTA ATTAATGAAA GGAATAATTA CCATTTTGAA 3000
AATAGACATG ACCAGGTTGT TCATACAAGA TGTAGCATCA GACACTCATG GCTTACACTC 3060
GCATATTTAT GAAAAGCGGA AGAAATACCT ATTGGTGACT TGTGTAAAAA TATTTTACCG 3120
ATAAAACATT TTAATATGTT TAAAATATTT CCCGAATAAA AACGTTCTCT AATATCATGT 3180
AAAAATACAC ATTGTGTTTT TAAATGATAT TGGAGAATGT TTTTATTCTG GAAATATTTG 3240
AAGTGAGCTG TTTGAAAAGG TGTTTTACAA TATTTATCTT TAATCTAACT AAAAGATTGT 3300
ATATGACTGT TTTCAGTGTT GTTGCTTGCT ACTTGTATGT TTTTTGTTGT TATTTTAAAA 3360
TGTATGTTTG CTAAGATTGT TTACTAACTG CAATGAGCGT CATCATGCTA ACTGATATGA 3420
TATGATTATA AATTGTATAT TTAGTACATG TTTTTTGCCA TGAATATAGC CAATGCTGCT 3480
GATATGGCAT TAAAACCTAA ATAAAATCTG TCCATCCATC CATCCATCCA TCGATCTGTC 3540
TATCTATCTA TCTATCTATC TGTCTGTCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCTGTC 3600
TGTCCGTCCG TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCGTCCGTC 3660
CGTCCGTCCG TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCGTCCGTC 3720
CGTCCGTCCG TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCGTCCGTC 3780
CGTCCGTCCG TCCGTCTGTC TGTCTACCCT CTTTAACCAT TGTCAATCAT AATTCTGCAT 3840
GACTTACAGC TTAATTTTAT GTTAATGTTT ATCAGGTTCC ATTTGGAGAA ATAATATCTG 3900
CTGCTCAAAG CCTGGTGTCG AGGCTCACCA ACACCCTAAG ATCACCAGAG AACACAAACC 3960
AACTAAGAGA GATTAGTTCA ACACAGAGAG AGAGAGGACA ACATCACGTT TCCAGAGCCA 4020
GTCAGTTCAG CAAGAAATGA GGTGTGAGAT TCAGTGGATG ACTGTATGTG TAGAAGAATC 4080
TAATGTGTTT TTTTCTCTAA TACAAATTGT TCCTACACTA ATGAGAAAAT ATTTGTAGGT 4140
CATTTCCTGG GTTTTTCCGA GAGGAGCGTA GAGGGAAAAG CTGTTTTGCA CCATATAAGG 4200
GGCAATGTAA AAGCTTATTA ATGTATTTTT ACCTGCTGGA CAAACAGCAT GAAAAAACAC 4260
CAAAAGGAGA GGCAGAAGTA CATCTCACTA TGGCTGGACT TGGAAGACAG CAGTTAAATG 4320
TGCAAGAAAA TTTCCCCCAT TCAGAGGTAT GATTAAAGTT CCATGCCCTG TTATTTTGTA 4380
TTTCTGTATT TGTTCCAAAA TTATAATGTA TTAATTAGGG ATGCTCATTT CGGTTAATTT 4440
TGCTAACCGA CAACCGTCGC TCATTAATCG GTTATTAACG GTTAACTGGT CAGATTACAA 4500
TTAATTTTAT ATTAAACAAA TTGACGTGTC TATTTTGTGT CTGACACATT AAATAATGCA 4560
TTTTAAAATA CTAATTTATT TTTATATGCT AGCACAGTGG TTCTCAAACT GT 4612