EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10271 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:31833709-31835887 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr16:31834037-31834055CTTTCATGCCTTCCTGCC-6.26
Foxd3MA0041.1chr16:31835189-31835201GTATGTTTGTTT+6.37
NEUROD2MA0668.1chr16:31835122-31835132ACCATATGGC-6.02
PBX2MA1113.1chr16:31834940-31834952GCTGTCAATCAA-6.32
POU2F2MA0507.1chr16:31834545-31834558TTCATTTGCATGT+6.92
RFX2MA0600.2chr16:31835688-31835704CGTTGCTATGGAGACA+6.12
RFX3MA0798.1chr16:31835688-31835704CGTTGCTATGGAGACA-6.08
RFX3MA0798.1chr16:31835688-31835704CGTTGCTATGGAGACA+6.11
ZNF410MA0752.1chr16:31835599-31835616TACAGACCATAATACTC+6.52
ZNF410MA0752.1chr16:31835850-31835867GACAGCCCATAATAATC+7.52
ZNF410MA0752.1chr16:31835758-31835775GACATCCCATAATAAAC+7.76
ZNF410MA0752.1chr16:31835725-31835742GCCATCCCATAATACTA+8.45
ZNF410MA0752.1chr16:31835522-31835539GACATCCCATAATAATC+9.12
Enhancer Sequence
CGTTTGCTAG TCCTGCTTTC ACGACTCTTC TTTGCTTTCT TCTTCTTTTT GGATTTGGGA 60
GTATCTGTTT CTGATATTTG TTCTTCGATA TCTGTTCAAA ACACAGACGT GAATGAATCA 120
TACATGAAAA ATTAAAAGCT GCACAATCCT CTTTCTTTTG ATTGCATGTC TGTCCTATCC 180
TTCCCAAGCA GAGAATATTA TATTATGCAT AAGACTGGAA TATGTGAAAT CCTAATTATT 240
TTCTTAAGGA CTAAGAACTA AATGCAATTA ATGACTTTAA TAGATGAACT TCTAGCCATT 300
ACAACAGTTT AGTCTTCAGA ATACATCACT TTCATGCCTT CCTGCCTTAA GATGTACCCA 360
ACTGTCCAAA TATGTTAGCA GCTGTGAAAC TAGGGCATAA GGCTCTTGCT TTTGAAATCA 420
TTCATTTATT ATAAGCTCTC TGCTGATAGG CTGCAATACC AGCGCCATTA CTGAGGGCAG 480
CCAGGAGAGG AAAAGCAAAA CAAATGGGTT CGACACACTA TGCTAAACAA TATTCCGCGC 540
GGTGTGATTG CTAAGGTACA AAATCAAGCT AGTTTCGCTT TTAATAAGTT AAGTACAGTA 600
TCAAATAGGT TTCTCTTCGT TTAAATGTGC TGGTTGTAAT ACAAGCCAGT GAATCAGGAA 660
GTGACTTCTG CATGCTGATG CTCCTTCATA AACTAAAGAT TGTACTTAAT AGGTACTGCG 720
ATGCGGTAAC ACGTGGCTTG GAGGCTCAAA CAAACAAAAC ATACAAACAT TCAATCCGCC 780
ATACTCTTCC TCACAGAAAC GGCCATTTGT CCAGATCTAC GTTGACAAGT CAGCAGTTCA 840
TTTGCATGTT TGGGCTCATT TTGGGAAGGT TATATAACAT GATGTGGTTA ATGAGGGTCC 900
GGACTCTGTT CTGGACAGCC TTACCGTCTC CCATGGGTTC AAAGCGGTCC CGGTCGTCTT 960
CACTCCCCGA CATTTTCCCG TTTGGACGCT GAATAAAACA GAAATGACCA CAGTATTTTG 1020
TAATGGGCTT TAGCAGCACC CCATGTTAAC ACCGAGAGAA ACAAGTGACA CGGGAGGCTA 1080
ACTGTGTTTA GATTAAATGA AATCAATTAA ACATGTTGGC ATGTCATCAT CACACGGCGT 1140
GCAGTGTTAA AAAGAGTTTG ACGTAGTCGT ATAATTTCGG CTTTTTTCGT AAACTTTCTC 1200
GTTCGGTCCG AGCAAAGGAA GCCTCAACTT AGCTGTCAAT CAAGTTAGCA AAGCTAGCAA 1260
ACAGAGTCAA GTGATCCGGC TGCAGGGAAA ATGGCAGCCG GCTGGATGAG TTGAGTTAAA 1320
GCGCTTATCT GCTGTCGTTT CTGGTTATAT TCGTCAACCT AAAACTTTCC TCCATGAGAA 1380
TACCACGCGG AGGTGGCGAA GCCCCCGACA AACACCATAT GGCGCGTTAT GACGCGAGGT 1440
ATAGCAGTTG TAAGTAACAG TTACCAGTAA TATTACGTTT GTATGTTTGT TTTCTGTTTT 1500
AAGCTACATT AAGAAAAAAC TCAACAAAAA CATACATTTG TATATCTACG TTATATCGTT 1560
AACGCGGGCG GTTGGAAGTG GGTGGGAGGA ATTGACTTAC AGGTCAGTCC AAGGTGTAGA 1620
TGGTCGGCGC TACGATCAGC TTTTATTCTG ACGCGAAATC TGCAGGTTAC TACCTACCAC 1680
TACAAAAATA AAAAAACAAG CTCCGAAAAG GTGTAAATCT TTGGGAGACG TCGTCCACTC 1740
TTCTCCCCTT TCCCCAGCGT CAGTGACCAG AAGCGAACAT CCTCGTACAC ACAAAGAAAT 1800
CAGGGGGGGT AGAGACATCC CATAATAATC CCAGGCACAC TGCCCCCTCC CTACAACACT 1860
CACTCAACTC TGCATAGTTA CCTCGCAACC TACAGACCAT AATACTCATC TCCCCCTCAC 1920
ACACAGTAGC AAGTATACAC TGCCTTCCCC TTTCTTAGTC CCTGCCCCCT TAGCAACCGC 1980
GTTGCTATGG AGACACTGCC CCCTCCCGCC CTCTCTGCCA TCCCATAATA CTAATAAGCA 2040
GGCCGCTCTG ACATCCCATA ATAAACACAA CTCCTAAAAG AGAGGGAAGA AAAAAAACAA 2100
CACCAGTCAC ATGGTCTCCA GGGAAACCCC AGGCCGCTGG CGACAGCCCA TAATAATCTG 2160
CGGCTGTCTG TCCACCTG 2178