EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10207 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:29593996-29596025 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr16:29595959-29595970TTATTTACATA-6.02
HNF4A(var.2)MA1494.1chr16:29594153-29594168GAGTCCAAATGTCAT+6.17
PHOX2AMA0713.1chr16:29594472-29594483TAATCCAATTA+6.02
Phox2bMA0681.1chr16:29594472-29594483TAATCCAATTA+6.02
RFX1MA0509.2chr16:29594082-29594098TGTTGCTATGGTTACC+6.34
RFX1MA0509.2chr16:29594082-29594098TGTTGCTATGGTTACC-6.35
RFX2MA0600.2chr16:29594082-29594098TGTTGCTATGGTTACC+6.44
RFX2MA0600.2chr16:29594082-29594098TGTTGCTATGGTTACC-6.52
RFX3MA0798.1chr16:29594082-29594098TGTTGCTATGGTTACC+6.42
RFX3MA0798.1chr16:29594082-29594098TGTTGCTATGGTTACC-6.49
RFX4MA0799.1chr16:29594082-29594098TGTTGCTATGGTTACC-6.17
RFX4MA0799.1chr16:29594082-29594098TGTTGCTATGGTTACC+6.72
RFX5MA0510.2chr16:29594082-29594098TGTTGCTATGGTTACC+6.11
RXRGMA0856.1chr16:29595083-29595097GAGGTGAAAGTTCA+6.07
RxraMA0512.2chr16:29595083-29595097GAGGTGAAAGTTCA+6.01
Enhancer Sequence
AAATAAAGCG ATGGTGATTA TAGATATGAA TGCTTTCAGG TGTTTTGTTA ATTAAGGAAT 60
TTAACGAAAA GTACTCAGCT CAATGTTGTT GCTATGGTTA CCTCCTCAGG CCAATGTGAT 120
TTTGCATTTC TGTTATGAAT ACAGAAAAGA ATATTGTGAG TCCAAATGTC ATAACATTTA 180
GTATGCCGTG CACTTTTAAA ACTAAAGGAT CCAAAAATAA CCCATTTAAA ACAGCTCTAA 240
AAATTACAAT TTTATTAGTT TACAAATAAT ATTTCAAAAT CTATAAAATA ATATTTTGTT 300
GAATGTTTTT GTGACTCGTG GATATTAAAG ATTCTTCATA GAACCACAGA ATGCTTTGAG 360
GGTTCATTTT ACTCTTCTGT TAACATTATT TTAAGGCTCT TAGGGAATCT GTCAGGTTTG 420
TTTTTGCTTA GAGTAAATTC AGAAGTTAGA AATATAGGCA GGACAAATTA CCCGATTAAT 480
CCAATTAAAT GGCCAGAGCG TTTATGTACT AACTGCAATT TTATTTTCCC AAGCTTAAGG 540
CAATTAACTG AACCAACAAA GCAGTGGCAG AGAACGGTTC TTATCAGCTG TCAGCTTACA 600
GTGTAGTGGA CAATTAACGA AAGAATTTGC TCCTTAATCA CAGAAGTGCT AAACAAGATC 660
AATGCACTTG ATTCAATCCG CACCTATGAC CCTCTTAAGA GTAACACGCG ACCTTTCCTA 720
AAAAACGCGA CCTAATAAAC AACAAAATTA CACGTCTGTC ATATTTCCAT TAAAAGGTAA 780
TGCGCCGCCA GTTTGTGAGA GTAAAAAGGG AGAGAGAAGT GTATTCGGGT AGGTGTTTGA 840
AACTTGGAAT ATTAATCATA TCTGTCTGTC AGTTTAATTT TTAGAGATGA GCAATTCTAG 900
CGCTTGAAAA ATTTTTCAGT GCGATGTGGG ACCGCTGTCT TCCCGCAGCA GATGCTGCAC 960
TATCGATCTG CGCCGAGCAG GGCTGAGGGA GGGAGGGGTG TGTGTGTGTG TATGTGCGCG 1020
CGCGCGGAGT GTGTGGCTGG AGGTAAAATG GTCAGCTCTT ACCGCAAAAA AGGTCTGTTT 1080
GAGGGTCGAG GTGAAAGTTC ACTCACTGCG GCTGGAGAGC TCGATAGATG ATAGTAGCCA 1140
GCACTCGAAT GAAAACAGCC CGATTCGGAG TGCACTGACA ATGCTTCATA AATTATAATA 1200
TGATTAAAAA TGCAAAACAT GAAGCTGAAT AAAACCTTAA TACATTAACT GTTCATTTTT 1260
ATAACGTTTA AAATACAGTG GCTTGAGGAT TAGAAATTTT AATTGTGCAA CTGAAACGTG 1320
ACAAACTCAA CATAATAAAC ACCAAGAAAA CAATAATAGG CCTACAGATA AACACAGATA 1380
ATCAGCTTTA TCATGTATAA AATTACGTCT CATTTCGCGC ACATCTGCGT TTTTCCCTTA 1440
AAACCGAGAA GAATAGCCTA TATATTGGAT AATACTTTTT AAAATAGCCT GCTCCATTCA 1500
TTTTAAAATT TAGCATGAAT TATAGACTAC ATTTTATCGG AGAGCTACAA GTTCGGCAAC 1560
ATGTAAGGCA CTGCTAAATT TTATTCACCT CTTTCCCTTT CTGTCTGGGA TACGTATCAA 1620
TGATCAAACA TTGTTCAAAA CAAACCGTGG AAATCAAAAC AGCGGCCAGC GAGTTAGTAA 1680
ATTATTTATA CCTGTCTATT GAGTTCTTTG AGCCTTTGGT CGAGCCACGT CCTCCTCCCG 1740
AGTGGTGTGT ATCAAGAGGC CTGCAGGTTA ACACGTATAC ATCAGGCTAA ACGTGCAGAG 1800
CTAAGCAGAT ACTAACAGTG TGTGTTCTGA GAAAGATATT AGATTTACTC ATTCATATCG 1860
TAATGTTACT GTACTGTCTC TAGGACGCTG GGACACGGTG TTAACGCCAA GCATCAATTA 1920
CATCTATTTT AAGTAGCGGC CTGACAAAAC TAAATACATA AAATTATTTA CATACATCGA 1980
CATTACATTA CATTATGTAT TACATCGACG ATTCAATTTA ACACAAAAT 2029