EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10203 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:29501078-29503159 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr16:29501682-29501693AATAAACAATA-6.62
POU2F2MA0507.1chr16:29501376-29501389TGTATTTGCATAT+6.41
POU5F1MA1115.1chr16:29501378-29501389TATTTGCATAT-6.02
RESTMA0138.2chr16:29501488-29501509AGCGTTGTCCATGGTGCTGAA-9.04
RFX1MA0509.2chr16:29502060-29502076CGTTTCTATGGCTACA-6.05
RFX1MA0509.2chr16:29502060-29502076CGTTTCTATGGCTACA+6.08
RFX2MA0600.2chr16:29502060-29502076CGTTTCTATGGCTACA+6.16
RFX2MA0600.2chr16:29502060-29502076CGTTTCTATGGCTACA-6.23
RFX3MA0798.1chr16:29502060-29502076CGTTTCTATGGCTACA+6.02
RFX3MA0798.1chr16:29502060-29502076CGTTTCTATGGCTACA-6.41
RFX4MA0799.1chr16:29502060-29502076CGTTTCTATGGCTACA-6.05
RFX4MA0799.1chr16:29502060-29502076CGTTTCTATGGCTACA+6.34
RORA(var.2)MA0072.1chr16:29501135-29501149TTGACCTAAATTAA-6.01
SCRT1MA0743.1chr16:29501266-29501281TTGCAACAGGTGTTT+6.53
SCRT2MA0744.1chr16:29501266-29501279TTGCAACAGGTGT+6.06
Enhancer Sequence
CTGTACAATC TTGTTTTTGG GGTTAAACAG TTGATGAATT TTGTGGGCGT GCTTCGTTTG 60
ACCTAAATTA AGGGAAATGT CAAATGTGGT TGTCAATGGT AACCGCTATG TAGATATAAA 120
TTATTGATAG CCTGCTAAAT TGCATAGCCC ACCGCGGGGC TGCGCAATTA TTTCCTAAAA 180
CTAATACATT GCAACAGGTG TTTGTTTCGC TCTGCGCTGG CAGAGATCTT AATCAATAAC 240
TGGCGTTTGA ACAGGGGGGT TGACGAGGTC GAAGCTTGCA GACCAGTCTG ATCTGGTTTG 300
TATTTGCATA TCGTTTTCCA TAAAGCAGTA GTTTAGCTAA GAGTATTTGT TCGCTGATCG 360
CATCCTTCAT TATTTTAATG AAGACGTGCG CTGAATTGAG AATTGAGGGA AGCGTTGTCC 420
ATGGTGCTGA AGTGGGCGGT CAAGTAAATT GCTCCTATAC CTTATTTTCT CATGTTTTAA 480
GAGGTTGTAA TGTCACGTTA CACTTAGAAG ATGAGCAAGA GACGTGTTGA TGTCTTTAAA 540
TAAACACCTG AATAGTGAAT CGCAGGGCTT TATAGATACA CAAGTCTATG AAGAACGTGC 600
CTGGAATAAA CAATAATGGT AGGTTTCGTG GAAATTTCCA TGGGCTATTC GAGAGTGTTT 660
CTCGCTGGTT CGCATGTTGT GCCCTGTGTC TTGGAAATGC ATCAGTTGCT GCAGTGCCAT 720
CATTCCCGTT CGCTCGCGCA CCTGCATTGC AGCTCTGAAG ATTGCGCCTT ACGCTTTTCT 780
TAAAACTACC AGCCGCGGAT GTAGCCCAAA ATAACTGCGT ACAGCAATGA CATTCATTGC 840
GAATACATGT TTAGGGAGCA AGTGGATGGT CGGTTGATGA AATTACTTAT TCAGTAGCCT 900
CCAGGAAGAA TCAAGAGCTT GTTTACTCAA ACATCTCAAG CAGACTACTC GATCTTGACC 960
AGCCTAACAA ATCTTAAAGA GACGTTTCTA TGGCTACACC ATCAAAAAGC CCTCCAGTAG 1020
TGTTGTATAA AGCGTCGGGT TTAGGCTATA AACACCGCTT TATTGACAGC ATGATTAAAT 1080
GTATTTGTGT TTACATTTTC CCCAAATAAC GCGATGCTAC AGCTTATTTA TCAGTGTAGT 1140
GCAATAAATA AACTTACGCA CTCTTAACCA CGATTAATAT CACATATATA CGTCATGATG 1200
TGAAGTCATG ACGTGAACAT GAGCCTCAAT CGGTTTTTGT TTTCAAAACA GCTATGTAAT 1260
GCAATCAGTG CCCTGTATTG GCCTGCTTCC AGTCACCAAC ATTGCCATTT GATTTATTTT 1320
ATCCTAACGG AAGTAGATAC GCAGCAGTTT TTTTTTCTCC CAAGGGAAAA ATAAGATGCA 1380
ATTTGTGCTA GAGTAAGGAT AAACATGGCT TTAGAAAAAT CCAGAACTTT CCACAGAAAA 1440
AAATACGTAT GCGTTATGCA GACTGAAACT GTAACGTTAA AGACAAATAA AGTCTTACCA 1500
TTCACGATGA ATTTCAGCCG AGGTGATTTT TCGGCCAAAA CCACTGAGAA AAGAGTTGCT 1560
AGTACGAGCA GATTCATGTT GCTCAGCGGT GCTCTAATTA GAGTGACGAC AAGCTAATGA 1620
AAGAGTGCTC TCGCTGAAGG ACTGGGGTTG TTTTTTGCAG AAGTGCGCGT GCGATAAGCG 1680
GACGCCGCCT CGCCTGTCTG TCCCTCAGAG CTCCGCGAGA AGCTGAGCGG TAATTGCCTT 1740
CACGTCACAC CTCCTGAAAG AGAGAAGGAG CGAGCAGACA TGCGCTCACC CCACTGACAA 1800
CTACTAACAG AGCAAAACAC TCACTTTATT TACTAGTTTC AGAGCTTCTC GATTACATTT 1860
GCTTGTTTGT CACTTTATAT GTATTATCAC ACTTAATATC AGTTTATATT TGTTAGAGAT 1920
CTATATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 1980
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 2040
ATCTATCTAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC A 2081