EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10193 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:29311788-29312580 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr16:29312514-29312531ATAAATTAATTAATTCG-7.22
Alx4MA0853.1chr16:29312514-29312531ATAAATTAATTAATTCG-6.65
ArxMA0874.1chr16:29312515-29312532TAAATTAATTAATTCGC-6.01
LMX1BMA0703.2chr16:29312568-29312579GTTTTAATTAA+6.14
Lhx3MA0135.1chr16:29312517-29312530AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr16:29312516-29312529AAATTAATTAATT+6.92
POU6F1MA0628.1chr16:29312518-29312528ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr16:29312518-29312528ATTAATTAAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr16:29312547-29312559TGTAAAAAAAAA+6.07
Enhancer Sequence
TGTTTCTGTT CTCGAGTTAT TTAGAAATCC ACGTCTGTCT GAACTACTTT ATAACAACTA 60
ATTTGCAACG CCACAGAACC TTTAAATCCC GAAAGCTCCA CAAGAAATAA AGCTATAAAA 120
ACCCTATAGA ACCTTTATAT CTTCACATCA TGTTTGTGAC ATCAAAGACT TGGAGCAGAG 180
TGAGGCATCT AACGTTAGTG AAGCAAGAGC AGGAGAAACA TTAGCCAGAG AAGTGGAGAT 240
AGCAAGATGA TCCACCACAA CGTCGAAGCG TGGGCTCGCC CATACACTCT TTTCCTGGTT 300
TCATGTCAAA CGAAGGATGG CTAATGAGAG ACGACAAGCG ACTGACGAAG GGACGAGTGG 360
TAATTGGCAT GGAGTCGTGG GAAACCATAA ACAAACAGCT GCCAATGGCA TTTTGTTTTT 420
TCTCATCCCT TATAGCGGTG AAAAGAATCA GAAGCGGAGC TGCTCACTGG CAGCTGGGAG 480
CGGAGCACGC ACGAGAGGCC CAAATAACAA GCTTAGGGAT TATATGGCGT GCCACTGGCA 540
TTACACATCA CAGGATCACG ACAACTCACG ATTAAATATT CACTTTTCCG AATGATCACC 600
GAGAAAAATC GGGGATTGTC CAGCATAACC GCTGCTTGTG AAAAATAGGT AGGCCTACCT 660
GATTCACGAC GGACGCCATT TTTGAATTTT CCCAACGCTG TGTTGTGGAT GTTGACTATT 720
CATATAATAA ATTAATTAAT TCGCTAATCA ATTAAGAAAT GTAAAAAAAA ATGTTAAACA 780
GTTTTAATTA AA 792