EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10172 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:28793604-28794526 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gmeb1MA0615.1chr16:28794386-28794403TTTTTTACGTAAGATGC+6.21
Lhx3MA0135.1chr16:28793634-28793647AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr16:28793633-28793646AAATTAATTAATT+6.92
NRF1MA0506.1chr16:28793679-28793690GCGCATGCGCG+6.02
NRF1MA0506.1chr16:28793678-28793689TGCGCATGCGC-6.32
POU6F1MA0628.1chr16:28793635-28793645ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr16:28793635-28793645ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AGTGAATTAG ATGTGTTTTG ATCCAATCTA AATTAATTAA TTAAAGTCTA TTAGAAAAAA 60
ATATGTTAGC TTTGTGCGCA TGCGCGTTAT GTTCCGTTGC CTCGGCGCCA AAGCCCAAAG 120
GAAGTTTTAC AGAATCCAGT CAGATGGAAG CAAGACGCCA GAGCCGGATT TCTGTACATC 180
CATTTGCACA GTAAGTCACA TTTTATATTG TACCAGACTG TTTATTACAG AAAAAAACTT 240
TGTGGGTAAC ATAGACGCAT AAAATGGTCT CTCGTTCGGA CTGTCTCTTT TGGTCGTTTT 300
TAAATTTCAC AGCGACCAGC CGTCGAGCGC GCTCGCAAGT TAAGCTAACA GTTAACGTTA 360
CACACGGTTT GACAAATCTC GCTTTTATGT CGCAGAATAT ATTTAAGATT CTTTTTAGCA 420
AGAATGTAGT TATGTAGACT TGATATATAA TGTTTTTAAT TAAGTAAATG GCTATTTTCA 480
AGAGAATCAG CATTTTCTTT GATGTGACGA CAGTGTCCGT GATCCGCCAT TCCAAACGAA 540
AAAAGTTTCG TTGCTAACGT TAGCTCAGTC CTTTGTGAAT TTACCGTGGC TTTTTACTAT 600
GGTTAACATT AAACATGCGT TTAGATAGTT GTGAACGGAC AGTACCATAC TGATTTTGTT 660
TTAGAACGAT TTGGTCTGGC GTTAGGGCAC TACTGACTGT CTTAGGAGGT TGTCGAATGT 720
GTGCCCATAC TGGCGTAACA TAACCTTTTA ACGTAAAAGG CGTCCATTTA TACAGTTCTG 780
TATTTTTTAC GTAAGATGCT GTAATTATGT CTTTGGGGTT ATAATGCTGT TAATGGGCTA 840
ACTTAGATTC ACAGCAAGTG TTTGTCAGCC ACCGATAAAC GTCCAGCGCA AGGTTAACTT 900
AATGTGACTT TTTCCATATT CA 922