EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10138 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:27406074-27407195 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr16:27406219-27406240GTAAAGAAAGTGAAAGTTTGC-6.29
IRF7MA0772.1chr16:27406222-27406236AAGAAAGTGAAAGT+6.29
SMAD3MA0795.1chr16:27406775-27406785TGTCTAGACG-6.02
Enhancer Sequence
TCAAATTCCT GGAACGAGTG GAATTTATAT AATAGTTTTT TTCTGTACCT TCCCAGTTAT 60
GATAATATCA TCATAAGGCA GTCTTCTTTA TGGTCACAGC AACCTCGTGT GCTCCTGTCA 120
GAATGCTTTG TCCTGTTGTC TTAGTGTAAA GAAAGTGAAA GTTTGCGCAA ATATATTTGT 180
GCTGCTGCCT TTGTTTGCTT CAAGAGCAAA ATTATACTGG TTAGCGTGTC ATGCATTTAT 240
TTATTTTGTC GTTGATTTAT TTATTTTTTT TGTTTGTTTG TTAGATCTAT GGCACTCTGA 300
CAATGAACAA GCGATCACAG TTATTGGAAC AGCTGCATTT TGTCCATCTA AAATGCACAC 360
CTCGAGGTTA GAAACTGTTT CATCCCTCTA AAGCGCTTTC TATAAGCCTG CGTGTGTATT 420
TGTGTGAGGC TCTCTGTCTG GTGCACGCGC GCGCACACAC TAGAGCTGTA AAGCATCGTT 480
TCAGTATGAC TTTATGTGGT TTAGACCTTC TTAATAATTT GACTTTTTAC GTTATGCTGG 540
CTGCGTTTTC ATTTTTTATT ATCCGTGTCA TGGTGAAATG TGGAGCTGAT GTAGAGAATC 600
GACGTGCTGT GGAGTTTGCA CGTGCACAAA CAAGTCATAA ACGGATACAC ACAAGAGATA 660
GTCAGACAGA AAGCCAGGTC CCGCTTTTTT ATGTAAGGAT TTGTCTAGAC GTACACATTC 720
TGAGCTCTTA AATTGGACGA AAAGACCTTG ACCGGCTGAA TGCCATATTT GTGCTTAACG 780
CAATTTTGTC TTCAAATTCC AAAACTAATT TAAAGCAAGT TTATCAGCAT GTCTGTGCTT 840
ATATGGCTGA CTGACATTCT TTTCAACCCA TTGAGTATTA TCTAAATTTA TTTGTTTATT 900
CGTTTATTTG ATCGATTTAT GTATTGTGAG TTTAAAATAA GAATGACTTG TTTTAAATAA 960
GCATTGAAGC AAATGTTTCC CAAGTGCTCG TTGGGGAGAT ATTTGTGTGT GTGATGTCAG 1020
TCATGAAAGT TTGACTCACT TTTGCAGTTC TCCATTTAGC GAGAGACAGA CTGACCTCAA 1080
ACATCCATTC CTCCGTCAGT ATCTATGACG ATGAAAGGGT C 1121