EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-10134 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:27298059-27298982 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr16:27298838-27298849TTTGATACATT-6.02
PBX1MA0070.1chr16:27298426-27298438ACATCAATCATA+6.11
PHOX2AMA0713.1chr16:27298338-27298349TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr16:27298845-27298859CATTAATAATTAAT-6.37
POU4F1MA0790.1chr16:27298846-27298860ATTAATAATTAATG+6.91
POU4F2MA0683.1chr16:27298846-27298862ATTAATAATTAATGAT+6.27
POU4F3MA0791.1chr16:27298843-27298859TACATTAATAATTAAT-6.19
POU4F3MA0791.1chr16:27298846-27298862ATTAATAATTAATGAT+7.08
PROP1MA0715.1chr16:27298338-27298349TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr16:27298338-27298349TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr16:27298338-27298349TAATTAAATTA-6.62
ZSCAN4MA1155.1chr16:27298667-27298682GTTTCAGTGTGTGTG-6.59
Enhancer Sequence
GTTTAAAGGA AAGGCAAGTT ATTAACATTA GTGGTCACTG GCGGAATTGT ATGAAATATG 60
AATTCAGGAT GGATTCTGAT TGATTATAGC TGAAAGATGT GAAAAAATAA TGAGCATTAC 120
TCATATATTT GTAACACTGA AATTTAAACG GATGCTATGT TATAATTAAT TAAGGGTTGA 180
ACGTTTGCAT AGTTTCAGCT ATAGCCTACT CAATGTAGCC GTTTAGACTC AAAACAGGCC 240
AGTTTATTTA GTCATTTACC TCAATATATG TCATAAACGT AATTAAATTA CAGTTTGTTC 300
TCTAATATAC AAATCCTCTT AAATTATAAA ATACCCTGAC TGAAACACAA ACGCGAATTC 360
ATAACGAACA TCAATCATAG TCTTCAATCT AGCATTTTTC TGTGGGCCTG TAGGAGGCGC 420
TGTGATCCAC TCTTACAATA TAAATGATCT CTCGGTGCCT GTGTGAGTTT TAGTCCCGGC 480
TCTATTATTT ATGTCTTAAC TGAGCGTAAG GTTTCCCTCT GGTTTACGCT TATCCCAAAA 540
GCTAACAGCG CAGTCAGAAT TATTCAGTAT CATATCAAAA ATGGATCCAT ATGGGCAAGA 600
AGTGGTGTGT TTCAGTGTGT GTGAGCGAGC CTGCGTGGAG TGTGTTTTAA TTGTGGTCTA 660
CTGGGCACTA TGTGCTACTT CAGGCCGAGA TCCAGTGTTT ATGATTTATG CATTACAATA 720
ATTTAAATCC ATGCTAAGAG ACAAACTCCT TTGTCATGTG TTTTTCAGTT GCTGGATGTT 780
TTGATACATT AATAATTAAT GATGTTTCAT ATATATTGTA TTGAAAGCCT TTAACATGCA 840
ATACTTTAAC CCGTTAACTT TCCACTTTAC CAAAATGATT GACCAATTTT TGACTGTTTT 900
AAATAATGAT TGATAAAATC ATT 923