EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09950 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:21436465-21437673 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr16:21436937-21436949GTTTGTTTGTTT+6.32
GabpaMA0062.2chr16:21437018-21437029CCGGAAGTGGC+6.62
TP53MA0106.3chr16:21437171-21437189AACATGTCTATGCATGAT+6.06
TP53MA0106.3chr16:21437171-21437189AACATGTCTATGCATGAT-6.23
Enhancer Sequence
TTAAAGATAA CCATTCATAT GATAAAACTG ACTAAAAAGC GACCAAATTG AGTCCTGATA 60
ACATTGAACT TACATTTATT TAGTGCTAGT GAGAATGCGA CAACGTCACG GAAAAGGTGC 120
TGTCAACTTG ATGTAGCACC GCCTTTTAGA GTGACGTAGG TGGTAATTCC CCCGCTGATT 180
GGTAAAGGCC ACTTTCAATT GCATCTGCGA ACCGCCCGCA GCAGAACCCA CGCGCACATC 240
AGCATCTTTT ATTTGCACAG TGAGTGCGAG GACTGTACAT GCTATGGACT CGTTTTTGAT 300
TCAGCCCTGA ATGCTACGTT TAACCGTTTT ATTTCTACAT ATAAAATAAA AGTTATTTTG 360
TTCCAGTATT TCACTGGACC CGTATGTTTT GCGTGAAGGT TTGTTACGTT AGTACCTAAC 420
GTAAACTTTA GGCTAACGAT ACAAGAGAAG ACAGTCTACT CAAATCTTTT TTGTTTGTTT 480
GTTTGATACT TGTGTTGTCG ACAAGATGCC GCGCGGATAC ATTTCGTAGT TCTTTTGGCA 540
GTTTTCTACT CCTCCGGAAG TGGCGGTCAT TTTAACAATA TCTCCAGTTT AAAAGGTAAG 600
TCTAAACTTC CTCAGTTATA GCTTACGACT GCTGTTAACT GTGTCATGGC GTTTCGTTAT 660
TTTTTTCTCC ACACATTTAT TAGTCCAACA TACCGTGCAA TCCGGAAACA TGTCTATGCA 720
TGATTTACAA GTACTGTAAC TACCATGTCA AGACAGTGTA ATAACAGTAA CGTTATATCT 780
CGTGTTTATC TTTTTTATCG GGCGTGGACG ATTGGATTGC ATATATAAAA AATCCCTTTT 840
GGCAAGAAAA GTCTAGAAAC GTTAGTCTGT TAGTTGCGTA TTAGTAATCC CTAAATTAAG 900
GGTTGGTTTT TCTTTTATAA ACAGTTGTTA AGTTACACGT GCATGGCGTT ACGTTATTTT 960
TGAAGAGCAG AAGGCATTTT GGCTGGTTTG TTAGGTGTTT TGGCTTGTCA AGGTTTTATA 1020
AGTCATATAT TTCTTCATGT GTCAGCATCA GAGTATTGCT CTGTTGATGA CTTAATCTCT 1080
TTAGATGCAA ATGGCTTCAT TAAAGTTGCA GTAGGAAATT TGGTGTCTGC ACTTCAAACG 1140
GATTAAATAA CAAGCAATCT ACAGTACAAC TTACAAGCTT TATTACCTTA GTACAATGAC 1200
ATGCTGAT 1208