EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09885 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:19159340-19161144 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr16:19159536-19159555GCACCACCAGGTGGCAGTC+6.45
CTCFMA0139.1chr16:19160777-19160796CGTCCAGTAGGTGGCAGCC+6.78
KLF4MA0039.3chr16:19159803-19159814CCACACCCTCT+6.02
Enhancer Sequence
CATTTTGATA TTGGTAAAGG TGTCTGCAAC TTTTGTGAAG CATCAAATCA CCGGCATATT 60
AACTGCCAAA ACATGTTTAT GACTGCATAA ATGTATTATT GCTTTTTAAA AAAAGTCACA 120
TATTGTGCAT TTCTATTATC ATACACAAAT TGTACAAAAG TGATCTAAAA AGTTCATATC 180
AATAAGTTTT CTCTTTGCAC CACCAGGTGG CAGTCTTGGT ACTTTTATTT CAGGGGTGTA 240
GATTACCATG CTTAGCCACA ACCTGATACC AGGGCATACC CAATGCATAA CCAAGATGAC 300
TACTGTAGTT ATGGCCCAAA CCAGCCACAG ATGGCTTATC GTGCCACCCA ACCTGTTCTA 360
ATGCCTCACA AACAGTTAGA AAGGATACAG CCACACAATC CAATAAGAAA TTTTGTCTCT 420
GCTGGCCGCC CACCCCCTGC TAGAGAGAGC ACCTACAGAG GCCCCACACC CTCTATACCT 480
GATTTCACAT CAGAAGACCC ACGACAATTC GCACGTTTAA AGATATCTCT TGAGAATTTG 540
CTACCACTAG ATGCTATGGA GCAGTTCAAA TATCAGATTC TTTTGGAGCA TTTGAAAGTT 600
GAGGAAGCTC TTCTTATAGC TGACTCATAC AGTAACTCCC CTTATCCTTA CTCATACACC 660
ATGCAATCTC TGACTGAACA CTATGGACAG CCCCACCAGC TGGCATTACA GAGAATTGCC 720
GAACTGATGG AAGGCCCCAA CATGCGAAGT GGAGATACCC AGGCTTTTAG GAGGTTCGCT 780
CTAAGAGTAA GAGCATGGGT GGGGATGCTC GACCAGCTAG GTGACAAAGG AAGTATTGAA 840
CTTCAGTTTG GCTTACACGT AGCTAGACTC ATGTCCAAAC TGCCCCATGA TCTTCGAGCA 900
AATTTCAAAA GGTACGTCCA CCCACTCAGA AACCCCATAC CTAACCTGTT AGATTTCTCA 960
GACTGGCTCG AGTTTGAATT GCAGGTGCAG CCCACAGACA GTAGAGTTCA TTTGAGTGAG 1020
CTAAAAGGAC GTAGTGTTCC ATATAAAGAG GCTCAGGGGC CACGCAAACA CCCTTAACAG 1080
CCAACTGCCA TCCTGCACAG TACAGATCAA TCTGTGAGCA GTACAACAAC AAAGGAGCCA 1140
GAGAAAGAAT CCTTTAACAG GTCAGTGTAC TTTCAATACT GTGACAACAA ACAACACTCT 1200
CTTAATCAGT GTAGTAATTT TGCACAGCTG CCTTCTGAGC TGAAAGCTAA CTGGATTAAA 1260
AATAATAAAA GATGCTGGAA GTGTAGAGGG AGACATCAGG CAGCACAATG CAAGCTGAAA 1320
GCTGCATGTA AGGTTTGCAC AGGAAAGCAT CTAACCACTC TGCATGATGT AAATAGCAGG 1380
TCTGCAGCAG CAAAGGGTCC CAAAGTGCAG CAAGAGAGTC AAATGCTATA CATAGACCGT 1440
CCAGTAGGTG GCAGCCAGGT TCTTCTGAAA ATCAGCAAGG TACTGTTGAA CAATGGCAAA 1500
CATACATTGA CAACTTATGC CATACTCGAT GATGGTTCAG AGCGCACAAT CTTACTGCAC 1560
AAGGCAGTGC AGCAGCTTAA GATCATTGGT GAGCCAGAGA ACCTTGCTCT GAGGACAGTC 1620
AGACTTGACA CACTAGTGCT TTCAGGTCCC AAGGTGTCCT TCACTCTATC CTCTGCCTCT 1680
CAGCCCACCA AGAAATTCAA AATACGGGGT GCGTTCACTG CAAACCATTT AGGGCTAGCA 1740
AAGCACTCAC ATCCAGTTCA AGCTTTACAA GAGAAATTTA ATCATCTCAA GAGTCTGCCT 1800
CTTC 1804