EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09872 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:18703828-18704754 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr16:18704526-18704536TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr16:18704526-18704536TTTAATTAGA-6.02
Alx1MA0854.1chr16:18704138-18704155TGATTTAATTAATCAGT+6.36
Arid3bMA0601.1chr16:18703862-18703873ATATTAATTAT+6.02
CTCFMA0139.1chr16:18703969-18703988TGGCCACCAGGGGGCCCCC+6.93
CTCFMA0139.1chr16:18704204-18704223CCGCCACCAGGTGGCGCTT+7.24
CTCFLMA1102.1chr16:18703973-18703987CACCAGGGGGCCCC+6.43
IRF7MA0772.1chr16:18704012-18704026ATTTTCGTTTTAGT-6.16
LMX1BMA0703.2chr16:18704139-18704150GATTTAATTAA+6.02
Enhancer Sequence
GACATGACAC AAACACAGAA GTGCCTTTAG TTCAATATTA ATTATGTTCC AGAGAATTAT 60
AAAACACACA GCAAGCATGA TTTGACAAAA CACAGAGCCG GCCCAAGGCA TAAGCGAACT 120
AAGCGGCTGC TTAGGGCCCC GTGGCCACCA GGGGGCCCCC AAGAGTGCTT GAAATTATTG 180
TGTGATTTTC GTTTTAGTTT GTTGAGTTGT GGATTAGTGG TGTGACAAAA TATATGCCCA 240
TTTATAGTGT TATTTCTGAC CGCGATACAT ACTCAGGCGC CAAAATATTT ACCTAAATTT 300
ACAAAAGATC TGATTTAATT AATCAGTTTT CCACACTGAC TGCAGCAGAT AACCGCTTTA 360
GCTACAGTAC ACCCAGCCGC CACCAGGTGG CGCTTCCCGT AACAGCGGTC GGTGGATCAT 420
GGGACATACA TCAGCGTCGT GTAAACAACA GACAGACAGA TGAGCTATTG CAATGGTGAA 480
AATCTCAGGC ATACAAAAAC TTTCTTCTGT CCAAGCTGGG CCAATGTATT TGTGTGTTTC 540
AGACATCCAG CTCCCCCGAA TATGCCACTA GTTTCTTTCT AACAGACGCG CTTTCACTTT 600
GCAATCGCTC GCGCGTGCCC GCGGCCAGTG CAACTTCTTA TGTGCTCAAA CTTTTTAACT 660
CCGCCAAAAT ATTTAAAGAT AACAATAGGA CATGAACATT TAATTAGAAT GGCCTTTTAT 720
TTGACTCTTA CAGAACTTGT CAAAGTCTTT TAGATGGTAT TTTGGCAAAA AAATATTAGG 780
GGAATTAAAT AGATGAGTAA ATAACTAATG TTCTCCATGC ACTGTTGAAA ACATACGTGC 840
TCAAAGGAGT CTGTGCTCAC CTCTCAGAGC ATTCTGATCA GTTGAAAAAA TAGTGGGGAT 900
ACATATTTTT TTATTAAAAA TAAACC 926