EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09742 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:16211766-16213212 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EN2MA0642.1chr16:16212826-16212836CCCAATTAGC+6.02
LMX1BMA0703.2chr16:16211953-16211964GTTTTAATTAA+6.14
PKNOX1MA0782.1chr16:16212840-16212852TGACAGCTGTCG+6.11
PKNOX1MA0782.1chr16:16212840-16212852TGACAGCTGTCG-6.14
SPICMA0687.1chr16:16211808-16211822TTCTTCCGGTTTTT-6.12
Stat4MA0518.1chr16:16212260-16212274CGATTTCCTAGAAG-6.5
TGIF1MA0796.1chr16:16212840-16212852TGACAGCTGTCG+6.32
TGIF2MA0797.1chr16:16212840-16212852TGACAGCTGTCG+6.07
TGIF2MA0797.1chr16:16212840-16212852TGACAGCTGTCG-6.18
TWIST1MA1123.1chr16:16212607-16212620AAACCAGATGTTA+6
Enhancer Sequence
AACTTATGAG CGAGAGTTAA TAATATGACA TAAACACAGC TATTCTTCCG GTTTTTGATA 60
TCATCCCTGC ACCACTCTAT TTCTGTCAAC TGCCAGTCAT GTGACGTCAG CATCCACAGG 120
TGGGCATCCA ATGTGCATCA AAACAGCTTT TTCTAGAAGC CCTGGTTAAT CTGGAGTCTT 180
GTGGATAGTT TTAATTAAAT ATCTCTGTTA TTATGTTTTT ATTTTCAACT GTTGCACCTT 240
TAATCAAGAG TAACGTTAAT CCCAAAACAC GTCTGTCAGC CTAAACAAGA TTTGACACTG 300
AATCAGTTAT GGCTCGGTAG CAACAACAAC AACAATTGTA GTAACTAAGG CATAACGTGA 360
TAACGTTTGT AAGGGTAATA AGAAGGCACG TAACGTTTAT TTTTTCCGGC TGGAGAGTGA 420
AATGCTCGGT ATGCAGGAAG TCAGCTGTTG TGTTTGTGTT GTTCCAGATT CTTTGCGCTG 480
TTTATAGCAA ACGTCGATTT CCTAGAAGGG GCAGGGCGAC GTGTTTACGG CTTCAGCCAT 540
TTACATAAAC ATTTCATAGA TTACACAGTC GAATCACGAG AAAATCAACA CTGGACTGGA 600
CAGTCGTGTA TTGCAAAACA TTATTATTTA CACTGATAAA AATAGTAACC GGGGCGTGTT 660
TTCAGTGTTG CTGGTCAGTT TTTTTAGCTT GATGGTTTTG TTTCCACTGC GTTCCATTTT 720
GCGCAAAAAA GCATTTGTTA CTTGTAATTA TAAATTAAAT CTATTAGCAG TCCGCTTTTC 780
CAGCTCGTTT GTGTTCGGAT CAGTCATGAT AACTGAGTTA GCTTGGCAAC TTGTCATTAT 840
AAAACCAGAT GTTACCGAAA AAACAGAGAC ACACACGTTT AGCCAGTATA TATAGACTAA 900
CGTTATAGAT TAACTATAAG AAAGAAACTC AATTTAATCG CTGTCGACTG GTGGACTTGT 960
TGTTATGACA CATAAACGTA TTGATAACAC TGCATGTCGT TACAAACAAG TAACGTTAAT 1020
TCCACCGATG GAGCATAACT GAATATAAAT AACATGCTTA CCCAATTAGC ACGATGACAG 1080
CTGTCGTTTT TTCTCTTCTT TTAGACCCTG AATAATTTCG CAGTTAACTG ATGAAACAGT 1140
GTTGACTCCA AATAAAAAAT CTGCTTCTCG CCTTTGTTGT GAACGGTCCT CGGCCGCCGT 1200
GAAGCCTCCG TCAATCACGC GCCGCTGGCC TCACTGAAAT TCCTTATTTC AAAATAAGAG 1260
ACCCATCAGT CGCGCGCCCG TTGAAGAAGC ACAGCCGAAC AGATGTAAAT ACAGGAAGGG 1320
TGGTTTTTTG AGGCTAAGGT AGCTTTTTCA CAGAAGACTA AAACGCCTAG AAACGTTTCT 1380
AAAAGTGATG TTCCAAATTA ACTTTTTATT GACATATTTA AAGTATATCA GTTAAATAGA 1440
GTAAAA 1446