EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09738 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:16025614-16026780 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr16:16026359-16026370ACCACGCCCCC+6.14
PBX2MA1113.1chr16:16025726-16025738ACTGTCAATCAG-6.04
RARA(var.2)MA0730.1chr16:16025903-16025920AGGTCATACTAAGGTCT+6.46
RFX1MA0509.2chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA-6.76
RFX1MA0509.2chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA+6.78
RFX2MA0600.2chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA-6.73
RFX2MA0600.2chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA+6.7
RFX3MA0798.1chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA+6.67
RFX3MA0798.1chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA-6.89
RFX4MA0799.1chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA+6.79
RFX4MA0799.1chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA-7.11
RFX5MA0510.2chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA-6.15
RFX5MA0510.2chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA+6.18
Rarb(var.2)MA0858.1chr16:16025903-16025920AGGTCATACTAAGGTCT+6.72
SP3MA0746.2chr16:16026358-16026371CACCACGCCCCCT+6.29
SP8MA0747.1chr16:16026359-16026371ACCACGCCCCCT+6.52
Enhancer Sequence
CAGGGTGGGC TGACGATCCA CTTGCTACAC TCTACAGAAA GGCTCTGAAA CCAGAACTGC 60
AAAGAGAGAT GGCGTGTCGT GACGAGGGAA AGACACTGGA CCAACTGATC GAACTGTCAA 120
TCAGGTTAGA CATTCTTCTC CGCACTCGTA ACCCATTGTG CTCTATCGCT TCCAGTCCTG 180
TATCTCCTGA ACCTCCCACT GAACCTATGC AACTGGGCAG AACCCGTCTA AACCCCGAGG 240
AATGTGAGCG AAGGAGGAAG AATCACCTAT GCCTCTACTG CGGACTTCCA GGTCATACTA 300
AGGTCTTATG TCCCAACAAG CCTCCCCCTA AGACCCTTCC GCCATCACTG CTATAGACGG 360
GCGCCCCCTG GAAGAGGGAC ACATAAAATT CCAAACACTG CCGATATCTC TTCAAACAGG 420
CTCTCTCCAC GTAGAAGAGA TTTCCCTCCT TGCGATAGAC TCTCCTCGAC ACACTGTAAT 480
CCTCGGGTTA CCATGGTTAC AACTTCATGA CCCTCAAGTT TCCTGGAGAA CTGGTGAGAT 540
CACTAAATGG AGCGATCATT GCTTTACCCA GTGTCTGCAT TCTGTTTCCC CAGTCCAGAT 600
CAACATGATC ACCAGTGCCG AAGACCCTGA ACTCAGTCAA ATTCCGGAAG TTTATCATGA 660
CTTAACCGAA GCTTTTAATA AGCAGAAAGC TACCGAGCTC CCTCCTCATC GTGAAAGCGA 720
CTGTGCCATC GAACTACTGC CAGGCACCAC GCCCCCTCGT GGCCGAATTT TCCCTCTCTC 780
TCAACCGGAG ACTGCAGCCA TGAACACTTA TATCTCTGAG GAGCTAGAAA AGGGCTTTAT 840
CAGACCATCC ACATCACCTG CTTCAGCCGG CTTCTTCTTC GTTAAGAAGA AGGATGGCAG 900
TTTACGCCCC TGCATCGATT ACAGAGGATT GAACGAAATT ACTGTCAAGT ATCGCTATCC 960
CTTGCCACTG GTTCCAGCAG CCCTTGAACA GCTCCGCTCA GCTCAGTATT TCACCAAATT 1020
GGACCTCCGC AGTGCTTACA ACCTCATCCG TATCCGACAG GGAGACGAGT GGAAAACCGG 1080
GTTCTCCACC ATCAACGGCC ACTATGAATA TCTCGTTATG CCCTTCGGCC TAGCAAACAG 1140
TCCTTCCGTG TTACAGGCTT TTGTAA 1166