EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09531 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:6649115-6650428 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX5MA0510.2chr16:6650125-6650141CGATACCATGGTAACC-6.05
Sox1MA0870.1chr16:6649761-6649776AAAAATGATATTGTT-6.11
ZNF384MA1125.1chr16:6650194-6650206GATAAAAAAAAA+6.02
Enhancer Sequence
ACTTCTCAAT GACATCACAT GTACTGGACC TGCTACACAT GTATCACTAT TTTTATGAAT 60
ACAAATTTCA CTGTAACAGG TGCTGTTGTT TTGCTCCAGT AATACCTTTA GAGAACACTG 120
TAGTAGTCAG GCATCCATAC AAAAGCCTTG GCGTGGAGTA GCAGAACTGC AGTCTGTCCA 180
GGCAGACACA GGTATAGGCT ATCTGCGTGT TCTTGATGCC CTCAACTGGA CCTTCCAGAA 240
AACCCAGAAA GTTAAAACCC ATTACACCTC TTATCTGCTA CTATACAAAG TGTAATTTAA 300
ACATTAATAT TTGCTCCCCA ATACTGTCAC AAAGTAACAT CACAACATGA TTTCACAATA 360
ATAATATCAA TATAACAATA TAATATCACA ACATAGCCTA ACAATCAATA AACAAAAAGA 420
TTAGAAAGAG AATATCACCA ACCAAAGCAC CAAGAAGATT TAACAGATAG GCTAGCTTAG 480
TTAAAGGTAA AGTAAACTTA CATGGACAAA GCCTTTTCCA TTCAATGCTG TGCAAGTTAG 540
TGCGTCTCTG GAGTACGTTA AGTTACATGT CTAAAAGCAA AAACAACAAC AACAGTGAAA 600
CGAAAGCAGT TCACTTTGTA ATAATAACAA TAATTATACA GCGTATAAAA ATGATATTGT 660
TTTATAACGT TGCTCAGTAA CTATAAACTG CGTTTGGAGT TTATCGCTTT GAATTTGCCA 720
TAAAAACGCT CATTTAGACT AACGTTAAAC ATGTGACATT ACCTCGAGGT TAGCTGCGCG 780
TCACCGGAGC GCAAACTAAA CCAAACTGGA AAGTTTTAAA TGCTTCAAAA TTCGAAACAC 840
TACACTAAGT CACATTTAAG ATACACTGTG TGTAAAACAA AATCGGGGGG TAAATAAAAC 900
ATTAAAGCAT CTAAAAACAC GCTTACCTCT GAATTCTGCT GCACTGCAGG TCAGGTGTTC 960
GTAATTAAGT GAAGTGAAGC GCTGCGCGCG GCCGCGTGCG CAGAGTCCTC CGATACCATG 1020
GTAACCAAAC ATGTTGAATA TTGGGTGAAG CCATGACGTT AATTCAACAT ACAGATCATG 1080
ATAAAAAAAA ATGTCAACGT TGATTTGTAC AAGGATTTCT GTAACTTTTT TCAACCATTT 1140
ATCATTCAAC ATTGTTTCAA CATTAAAGCA ACAACTGACG TATTTTCAAC CACATTTCAA 1200
CGTTGAAGCC TTGTCATATG CAGGCTGTTT TTCAACCGTT CAACATTAAA CGTTCTATCA 1260
ACATTATTTC AACGTTCAAA ACACATCTGA CCTTATTTCA ACCATATTTC AAC 1313