EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09519 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:5999460-6000374 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr16:6000221-6000232TATGTAAATAA+6.02
HNF1AMA0046.2chr16:6000223-6000238TGTAAATAATTAATT-6.38
HNF1BMA0153.2chr16:6000224-6000237GTAAATAATTAAT+6.42
HOXB9MA1503.1chr16:5999691-5999701GTCGTAAAAT+6.02
HOXC10MA0905.1chr16:5999691-5999701GTCGTAAAAT+6.02
HOXC11MA0651.1chr16:5999690-5999701AGTCGTAAAAT+6.02
HOXD11MA0908.1chr16:5999723-5999733TTTTTACGAC-6.02
Lhx3MA0135.1chr16:6000226-6000239AAATAATTAATTA-6.71
Lhx3MA0135.1chr16:6000229-6000242TAATTAATTAAAT+6
POU4F1MA0790.1chr16:6000224-6000238GTAAATAATTAATT+6.11
POU4F2MA0683.1chr16:6000224-6000240GTAAATAATTAATTAA+6.39
POU4F3MA0791.1chr16:6000224-6000240GTAAATAATTAATTAA+6.38
Enhancer Sequence
ATAAACATTA TAGGGAGCAT GTCACAAGTT GTCACTGAAC AACTGTGAGA CTATAAAACT 60
AACTTTACCC CAATATTGAA GCTGGCACTT GTGTGTAACG TTATAAGCAT TAATCTTACC 120
ATACGACGAA TGGTCTCCTT TAAGCGAAAA TAACGCCAAA AGTCCAGCTC AGATCAGATT 180
AAGGGTAACT TGAAAAGTCG CTGAACACAA TCCTGTTTTT CTATCAAGCC AGTCGTAAAA 240
TAAAAAATAT ATTCCGTGGA CTCTTTTTAC GACGCAGCGG ACATCATTTC GTAATTATCT 300
GGCAACAATG ATCCCCGGCT CCCTTTCAAT GGACCTGCTG CTTGAAAAGT AGCACGGCGA 360
TATTGTCCAG CTTCGTCTTT CTGTTCTCCA GGAGATTCGA GTATCTGTTC CCATTCAGAG 420
ATGATCAGGG CGAGAGAAGA GCTGATAAAT ATGATGCGCT CTTCCCCAAT GATAAAGGAC 480
GTTCTCCCCG GAATCCCATC TAAAAAAGCC GGTATCACAC GCTACACGCT CTCCGCCCCA 540
CACATTACTG ACCTCTCTCT CTCTCTTTCT CTCTTTCTCT TTCAACCTCC CCGAGCGTGA 600
CGCCACTCCC CATCCTCACT AACCAGCTTT TGCAACTCTC TTTCACAACT CACTACTTGT 660
TGAAGAAAAC ACATTTGGCT GTTTCCTAAT TAATGATTTA TAAAAGTATG CTATTTTGAA 720
TGACCTCCAT ACACGTGGCA GCATTGTTAG CACACAATAA TTATGTAAAT AATTAATTAA 780
ATAAATAAAT AAATAGCAAG CATCCTTTAA ATACTTCCTC AGCGTGGTGA ATTCTTGCAC 840
ATAGCAGAAA ATATTACTGC AGGTAGGTAG TGTAAGGGGT GGTTCTTTTC TCTCAAAAGG 900
TGGAACTTTT AGTG 914