EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09506 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:5351997-5354075 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr16:5352957-5352974CTTAACTAATTAATTCA-6.19
ArxMA0874.1chr16:5352957-5352974CTTAACTAATTAATTCA+6.27
HNF1AMA0046.2chr16:5353230-5353245GGTTAATCATTGATC-6.61
HNF1BMA0153.2chr16:5353231-5353244GTTAATCATTGAT+6.62
LMX1BMA0703.2chr16:5352387-5352398GATTTAATTAA+6.02
MLXMA0663.1chr16:5352066-5352076ATCACGTGAT+6.02
MLXMA0663.1chr16:5352066-5352076ATCACGTGAT-6.02
MLXIPLMA0664.1chr16:5352066-5352076ATCACGTGAT+6.02
MLXIPLMA0664.1chr16:5352066-5352076ATCACGTGAT-6.02
NRF1MA0506.1chr16:5353398-5353409GCGCATGCGCG+6.02
NRF1MA0506.1chr16:5353397-5353408TGCGCATGCGC-6.32
PBX3MA1114.1chr16:5352116-5352133AGACCTGTCACTCACAC-7.01
POU1F1MA0784.1chr16:5352942-5352956TTAATTAGCATATG-6.18
POU3F1MA0786.1chr16:5352943-5352955TAATTAGCATAT-6.44
POU3F2MA0787.1chr16:5352943-5352955TAATTAGCATAT-6.62
mix-aMA0621.1chr16:5352961-5352972ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
TTTTGTTTAC AAATGTTAAG TAATGTAATT TAGATATAAT AATTTATATG AGTCTTCGAC 60
GTCGACTGTA TCACGTGATT AATTCAAACC AATGACGGGC GGCTGGAACT CTGCACGAAA 120
GACCTGTCAC TCACACGCCA ACTCCAGCTT CATGACCTCG TCGGCCAGCT GCGCTAACCG 180
GGTAACGTTA AGTTTATCAA TTGTCTTTTG ATTTCGGTAT TTTTTTAGGA GTTTGTCAAA 240
AGTCCTTGTG AATTTGTTCA TTAAACCTAA ATTAGTATAC CAATGTAAGG GTTAAGGAAA 300
CCTTAATGAC GTTATACGTT ACTTGCTATT TAAAAGCAAA CGGTTAAGGG TAACGTATAT 360
GCTTTGCCTC GGTGAACCAG TTACATACTT GATTTAATTA ACGTTACATC TAATTTATTA 420
ATTAAACTTA TCATTATGTT TTCAGTGTTT TGGCTGATGT TGAGTGCTTC TCAATGACAT 480
TTGTGATGTT AAATAAACTA TTAATTGATG ACCATATTTT TTACTGTTTA ACTTCCATGT 540
GCGAGAAAGT GTACAATAAA ATACAAACTA TGCATGTAGT TTTATTTACA CCTGCAGTAC 600
CGATGCCTAT TTTACAAGAA ACATGTTTGG TGAACACTTA TGCTGTGTGT TGGTGCTCAT 660
TATTTACCGC GCTGAATATG ATTTGGTGCA AACAGGCGTT CACAATGGTA TGGACCATTA 720
TAGGGGTGGT CTAGTGTATA TTTAAGTTAT TTATTATTTT AATTATCAAT ATTATTTAAA 780
ATACAGATCA AAGCGAACTA TTTCTTAACT ATTACAGGGC AGACCTCTCC CCATACGTCT 840
TGTTTTGATG TCCTTAAGGG GAGATCAAGC ATTAATTAGG GGGGCCTGAC TCCCCAACCC 900
CCCTTGTTAT TCGCACCCTG GTTGTAGGCT GGTTAATGTG AGTTATTAAT TAGCATATGC 960
CTTAACTAAT TAATTCATAA TAAAGTAATG TTTAGTTTTC ACATTAGTAC ATCATTATTT 1020
GTGTACTGCT GTTACCGGGT ATAATTCACA AGCACACCTG CCTGTCTCTT TAATTTAACC 1080
GTTTGTCGTG TTAAAGCTCG GTCAGATACC GGACAGCACC CGGTCCTCTA TCCAGATCAT 1140
CACCGGGGAC TTCATCACTG CAGCTGCAAC CAGCCGGTGT GCTTTAATCA TCTTTATGGC 1200
AGCACTTTTG GCGCAATGGC TTTGTTTTCC TCGGGTTAAT CATTGATCGC TGACGTGTGT 1260
GTGTGTGTGT GTGGACGTCT CTCAGCATTG CAGATCCAGC ATTTCCAGCC CTGGTGCTGC 1320
GCCAGTCTGA CCGCACCGCG AGCCTGATCC TGCCGCGCGT GGATTCGGTG GATCCCGGTG 1380
AAGAGGAGCG CGTGTCCCGC TGCGCATGCG CGTCAATGCC GCTCTGACTG AACTGAGAGG 1440
AGAGAGAAAA AGCTGAGACG GTAAATTACC ACACATTTCT GCATTACAGT TTCTTTATGT 1500
GACATCTGGG GTTTATTTAA CGGCAAATTG TAAGGAAGGA GAACAGAGAG GTGCATGGAT 1560
GTTTTAAAGA GACGGACGGG TCTGCAGTGG TGTATAAATA TGAGTGCTTC CACTGCACGT 1620
CCTATATGAA TAGTTATTAT GCGACTTTAA TTGTAAGTCA TCGAGTAAAT GTAATGATTT 1680
GAGGGTGTTT ATGGTTTCAG GAATGTCTGT GTAGCACAAT GCGGATGATT ATTCTTCACT 1740
TGTCATCAGT CATGATTGTT ATTCTCATTG TTTTATTGTA ATGTTATATC GTGTTACACC 1800
CATGTTGTCC TCATACTCCA GCATAACTGC GTTATAAATG GGTGTTTCTT CAGTTTTTAC 1860
CGTGTGGACC TTATACACTG TTAAAAACAA ATGTTTTAAA AATATCTTCA TGTTGTCCCA 1920
ACACAAATCG ATTAAGTTAA CGTAATTCTT CTTTACATAT TTAAGCGGAT TGAACAAAAT 1980
GCAACTAAGT TGTCCCAAAA CAAAGCTTAA TGATCATGCT GATTCTGCTC ATTTTAAATA 2040
AGTGGATTGA ACAAGCAGTA AAAATCATTG TTTGAGTA 2078