EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09503 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:5284437-5285496 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr16:5284710-5284721ATAATTAATAT-6.02
CDX4MA1473.1chr16:5285159-5285170GGTAATAAAAC+6.14
CREB1MA0018.3chr16:5284772-5284784AGTGACGTCACC+6.22
CREB1MA0018.3chr16:5284772-5284784AGTGACGTCACC-6.22
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr16:5284772-5284784AGTGACGTCACC-6.18
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr16:5284772-5284784AGTGACGTCACC+6.32
Foxd3MA0041.1chr16:5284655-5284667AAACAAACATAC-6.37
Foxq1MA0040.1chr16:5285197-5285208TATTGTTTATA+6.32
HOXA10MA0899.1chr16:5285159-5285170GGTAATAAAAC+6.02
Enhancer Sequence
TAAGTGACCA TATTAAATTT TATTATGCAT TAAATTTATC ACAACCTTTT GCTAAGGAAT 60
TAAAACAACA ATTACTTTGC GTTTTATAAC TGCACAATGA TCCTTTTTGT CTTTTAGTCA 120
TCAAATGATG TTTGTTTTTA ATATTTGAGT GTTAATATTT TGTAAATTAC GGTTATAATG 180
TAGCTGTCCT AGCCTTTTTG TTTTGCTAAC GAACAAATAA ACAAACATAC GGACATATTT 240
TGTTCTGTAC TGAAAAATGA ATGCATAAAA ATTATAATTA ATATCAGATT TTAGACGATA 300
TTCCATGCAG CCGCCTGAGG AGTCTCCGCC CAGATAGTGA CGTCACCTTA TGAATATTGA 360
TCAGTCTAAT GGTGGTTTTA CGACGCTCTT CACTGCCGTC ATTTTCTTCA CGGAGCATGG 420
AGATGGGAAG ATGAGATGTT AAAAGGTAAG AATTGTGTTT ATCTGTCATT AAGAGACATA 480
TATGTGCGTT GTTATTATGT GTGTTGTTCG TCTGGGCACA AAAAAAGCTT GAACGGTTCA 540
TTCACCTTGG AGAGGTTATG AGACAATACC TCACCTCGAC ATTATATTCA ACAAAATATG 600
AGTAAGAATG GCAGAAATAA AGTATTGTTC GACATGGATA TAACCAAGTG GAAACTAAAA 660
TGATATTTAT GCTAATAACC TTAATTATTA TCCTACGTGA ATAGCTCATG TACCAACAAC 720
AGGGTAATAA AACAAGCTGC GCTTTAGTAA CGTCTCTGAA TATTGTTTAT AATAATTAAT 780
GACGTCTCAT CTACATTTTA ATCATATCCC GGCTGCTGGA TCAGAAAACA CTCGGTGTTT 840
TTGTTATTTA ATATTTCTTT ATTCGTCCGA AAGTGATATG GCTATGGAAT TTTTCGATGC 900
AGAGAAAGAT ATCTTTGTTT TGTTTTATTA TTTTATAAAA GACGTTAGAC AGTAGTCTAC 960
TATTTTGGCT TGATATGATC AGATTTACTG TAAAGATGTT GGTGAAATGA ACAGGCCTGT 1020
GCTGAGCCAC ACCATCACTG ATGATGACAA CATCTGCTC 1059