EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09465 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:3252023-3253198 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr16:3252952-3252964AAAGTAAACAAA+6.62
FOXP2MA0593.1chr16:3252953-3252964AAGTAAACAAA+6.62
Foxj3MA0851.1chr16:3252950-3252967AAAAAGTAAACAAATAA+7.28
TFECMA0871.2chr16:3252498-3252509CCCACGTGACA+6.02
Enhancer Sequence
ATGTATTTGT AGCCAACTTA GTCATTTTGA TAGTAGGCTA ATATAGCTAA TATAGATCAA 60
CACGTTCTCA CTCCCAACTC GTCATATACT GACGCTTGGT CAGGAACCCT CGNNNNNNNN 120
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 180
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNGCGTAAGT TATTGACGCA CAGGGTACCC 240
CTTTAGCGTC ACATTTAGAC GTGCAGGGAT TCCCTATAGA ATCTGTACCT GAGCCTGAAG 300
CGTCATAGGG AGACGCTGGA GGCTCGTATA ATTACCAATA GATGTCAACA AACTTTTTAA 360
AACCTGATTT ACGCCTATTA TCACAGTTTT CTTATTTTAA AAATATGTAA TTTTTATTTT 420
GTTTATGAAA AGCGTCTGTA AACGGGGTCG AAACTACTGT ATGAATAAAC TTCGGCCCAC 480
GTGACATCCC TTCACGGTGA GTTTAACGCC GCTCTGCTAT TGGTCAAACT GCATCAGCGG 540
TGAGTTCTCA GATGAGTTCA ACTGTCAACA TTAAATATTA CGTTAATGCT GCATAATATA 600
TTTTTATTGG AGATTAGTTG GTGTTTATAA ATATGTTATC ATTTACTTTA TATTTAATGA 660
GTGAAAATAT ATTCGGTTGT CCAGTTTAGG GTAACTATGC CTCATAAAAC TTTGATTCAT 720
TCATATTATT TATTATTTTT TTTACTTAAA AAAAATATTA AATTTCAAGT ACTAAGTTTA 780
AAAATGTTTT CGGCTGATAT TTTTCATTTA AATTATTTAT TAAAGTTGGG GTCATTGTAT 840
GTGGCGATCT ATTTTTTACA GTCTATGCTC GCTATCCCAA GGTTCATTGC GATCCCAAGG 900
TTCACTGCGG TTTTCCACAA GGTAAGTAAA AAGTAAACAA ATAAAGACGA TTTGTTGATA 960
AAGCATGTAC TGTAAACTAG CGACGTTATC TAATTACATC AAGTTCATTT ATTAAAAACA 1020
TATTTTTCTC ACATATAACG TTGGTCATGC ATTAGAACAA TATATACATT TTAAGATGAG 1080
GAACAGTGCT AACACATTGT TGTTTTCCAC AATAGAATTC GTGCAAAATC TATATATAAT 1140
ATGCAATATG CAACTCTAAT AATACAAATG TATTC 1175