EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09437 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr16:2904062-2905209 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX2MA0600.2chr16:2904698-2904714CGTTGCTGTGGCAACC-6.02
RFX2MA0600.2chr16:2904698-2904714CGTTGCTGTGGCAACC+6.05
RFX3MA0798.1chr16:2904698-2904714CGTTGCTGTGGCAACC+6.03
RFX4MA0799.1chr16:2904698-2904714CGTTGCTGTGGCAACC+6.23
RFX5MA0510.2chr16:2904698-2904714CGTTGCTGTGGCAACC-6.48
RFX5MA0510.2chr16:2904698-2904714CGTTGCTGTGGCAACC+6.68
Enhancer Sequence
GCTCTCAGTT TCCAAAAGGC TGGTGACCCC TGATTTAGAC CATATTTTAT TCTCAACACA 60
TTACAAAAAA AGCAGTAATG AAGCTCTTCT CCACTTCAGT TAAAATGATA TTTAACAAGA 120
CATCTCACAT TTTAGTCTGT TATTATTAAC CTGAGCTGAG GCTTGAAATG TAATGGACCT 180
AATGTACGTT AATCTACCAG GGTTACATCC ATTAAACATC CTTTAACATC CATTAAAGCA 240
CTCTGAAACA CAATTTATTA CTCTGGTAAA AGTGTATTAT TATTCAGTCA ATTCACACAC 300
AGTCAGTGCG ACATCACATG ATCAAAGACA ATTCTCAAAG GGAAAAATAT TATTAGCATG 360
CTGCAATATT AGCCTATCAT ATTATCCAAC TCGGTGCACC ATATTGTAGC TTGCGCTAGC 420
TAATTCACTT TAGCAAGTTG GCAAAAAACA TATATTATTA CAATAATTGG GACTAAGAAC 480
GGCTGCTTTG GTGACTTTAA CATTAAAGAG TATCTCGTAT TATAGTGTGA TGTAAAACTC 540
GCTAAATTAA TCGTCTGTAA TGATGTATTT TGATGACAGA TCGATCAGTG AATGGATGCA 600
TTTTTTAAAA TGCGGGTCTC CGCCATGACG TAACTCCGTT GCTGTGGCAA CCATGGAGTG 660
CGTTCGGAAT TTGAGTTCTA CTGACTGTAA CCGAGCGAAA AACGCCATTA GTGTGAAAAT 720
TGTCGTGTAG ACTAAATGGA CGCAGAGTTT CACCGTAGTG AAGAAATCCA TACAGTTTGT 780
CGACGCGTTT TTAACACAGT GTGTAAGAAA ACAAATATCA TGACTAACCT GATTAGAAGA 840
AACGCCGTGA TGCCGGCCTC GCTGGACGTC GAACATCTAC AAGATCCAGC AGATGGCGTA 900
GCCGGGCAGG CTCAGGCTGA GGGCGGCTTC GGCCCCTCTC CTGCTGCCGC CCGGAGCATC 960
AGCCCTAACG GTAAATGTCG AAAAGAGCAT TTGTCAACAC ATTACTGTCA CACATAAATA 1020
CAAACACAGG CTCTCTGAGC TGTATAAACT TCACTACAGG GCGTCTTATA TGTTTAGTTA 1080
ACATATTTGA ACACATATAT AGACTGTAGG TCGTCTTAAT GGATGATAAA ATACATGTAA 1140
ACGTCAA 1147