EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09272 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr15:45387391-45388297 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr15:45388070-45388083ACATTAATTAATC+6.03
NFYAMA0060.3chr15:45387853-45387864AACCAATCAGA+6.62
POU6F1MA0628.1chr15:45388072-45388082ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr15:45388072-45388082ATTAATTAAT-6.02
RFX1MA0509.2chr15:45388099-45388115AGTTGCCATGGCAACA+7.64
RFX1MA0509.2chr15:45388099-45388115AGTTGCCATGGCAACA-7.64
RFX2MA0600.2chr15:45388099-45388115AGTTGCCATGGCAACA+7.82
RFX2MA0600.2chr15:45388099-45388115AGTTGCCATGGCAACA-7.84
RFX3MA0798.1chr15:45388099-45388115AGTTGCCATGGCAACA-7.48
RFX3MA0798.1chr15:45388099-45388115AGTTGCCATGGCAACA+7.86
RFX4MA0799.1chr15:45388099-45388115AGTTGCCATGGCAACA+7.62
RFX4MA0799.1chr15:45388099-45388115AGTTGCCATGGCAACA-7.63
RFX5MA0510.2chr15:45388099-45388115AGTTGCCATGGCAACA+7.83
RFX5MA0510.2chr15:45388099-45388115AGTTGCCATGGCAACA-7.86
Enhancer Sequence
ATCTTCAAAA ATAGGCTCCA AAAAAACGGA GAGAGCTGTG TTTATATTTA ATCGAATCTT 60
CAAACCGAAT CATTTGTTTT GAATCACTGA TTCGGATCTT GAGTCAACTG ATTTCAGCTA 120
ACGAGGCTTC GTTGCGTCAT ACTGATTCTA ACGGTGGCTT TAAAATAATA ATAACATTCA 180
GATGGTGATT TTTCTGGGGG TAGATGCACA AGTGCTGATC TTAAGCCAGG TTTGTAATAT 240
AGCATATATT TTTGTATTAA TTTAATGATT ATTTTAATCT AAATATTGGT TTGCCAACAC 300
ACAAAACAAG GTTACAACTG AGGCAGCACA TTTCACTGGA ATATCATTTG TATTACGGTA 360
ATATGGCGTA TTTGTAGGTA TTTAATTATT TGTAATGTAG CTTTGTAAGA TGTAGTTTGG 420
GGTTTTCGTT GCTTTTCCAA TGCGTTTCAG TCAGTTGGTT ACAACCAATC AGAATCCTCC 480
ATTTAAAAAA AGCGCGCGGT TATATTGTTT TCTCCTTTAA ATATGAAATT ATAGTGGATT 540
ATTTTCCATA TTTTAAAAGC TGGATAGAGA TAAAAGGCTT ACAAAACACC ACAGTCTGGT 600
GGCACCTCCC AGCAAACACC ACACATGAAA AATACCATAG TAATTAATAG TAAATACAGT 660
GTTTTTGAGA ATATAACGTA CATTAATTAA TCAGTTAAGG TAATTCAAAG TTGCCATGGC 720
AACACAACAA CAATAGTAAT ATAAACAAAT GAGCCAATAC TGTTGTTTTC TACAAATATA 780
GGCTATAATA CTACACCACA GTTTACTGTA GTAAAAACTA AAGTATACTA CAGTATTAAT 840
TTCAGTTTAT CAGTTGACTC TAGTTAATAC TATAGTATGC TACAGCTTTC ATTACTAAAA 900
TGGTTG 906