EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09172 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr15:42329281-42330311 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr15:42329687-42329702TTTGTTTGTTTAGTG-7.26
Foxd3MA0041.1chr15:42329686-42329698GTTTGTTTGTTT+6.32
LHX2MA0700.1chr15:42329898-42329908ACTAATTAAC+6.02
PBX1MA0070.1chr15:42330263-42330275TCATCAATCAAT+6.44
Enhancer Sequence
GTCCGGTGGT GGCGCTCTTC CCCCACAGGC TTGTGGACTC AGCGTTTGTG GAAGGTTGTG 60
TGGTGGATCC CTGAGCATAA TCTCACGCGG CCTCGTCGCG AAAATCGATT GTACACATGT 120
TTATTCGGAT CCAGGAAATT ACATCTAAAG ACATATCAAA TTAATAACAG CCATGGACAT 180
GGAAGCGGTG AACGCCTTTA ACGGGGAGGT GAGAATTTGC GTTTTATTTG TCGTTTACCC 240
GTTAGCATTG ACCCAGCGCG CGCGATTAGC CGTTTCAAAA CATTCCTCGT TTCGTGCTTT 300
TTGTTTGTTA CTCGACATTT TCAGACGTTG TTTTTTAGTT TAGACTCCTA AATTCAAACG 360
AAACCCTAAA TATCATCAAG CTGAGGTGAT ATGAGCATAT TTAAAGTTTG TTTGTTTAGT 420
GACCTTCCAC CGGTCACACT ACGGTTAGTT AAAATTCAAT TCACCGGTAG CATTAGCTTT 480
GTATGTTGTA TACAGATGCT AAACAGTCGA TACATTTTGC TTTATAGTGA TTAATGTCGT 540
TCGTACTGTT TGTATTTTTT AATATAGTAG AAACGAGTGT CGAGAGAATT ACAGTGGCGC 600
CCCCTATTGA ATCAGTTACT AATTAACCTC GTTGATGATT TGATCAAGTG TTATAAACTG 660
TTGTACATTT TAATTCTGCT TTTTAAAAGT TTGTGATGAG GCTTTATTAC TTGCCATTTG 720
TGTATTTCTA AGCTCTTCCT TTTGCCTTTG AGATTGCCAG TTACGAAGCT GATAGTTTTG 780
GTTTTCTGTT GAGTTGTTTT GGTGTTGGTG CAGTCAGGAT ATGACGTTTT CCCTCTTGTT 840
TTATCCTCTG TAGATGTCGT CCATGATGGA CATGACTCCC CCGATCTCTC GAGCCAAAAT 900
GATGTCTGTT ACCAAAGCAG GAATCAAAGC TATCAGGGTA AGTCAAGGCA GAAATATAGT 960
TGTGTGTGAG ATTTGGGCAA GGTCATCAAT CAATTAATAA GGATGGCTTT TGTTTTAGCT 1020
ATTTAAAGTC 1030